세균역 생물 목록

일반적인 세균에 대한 내용은 세균 문서 참고하십시오.

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1. 그람양성균(Gram-positive bacteria)

1.1. 후벽균문(Firmicutes)

1.1.1. 간균강(Bacilli)

1.1.1.1. 간균목(Bacillales)1.1.1.2. 유산균목(Lactobacillales)

1.1.2. 클로스트리디움강 (Clostridia)

1.1.2.1. 클로스트리디움목 (Clostridiales)1.1.2.2. 할라나이로비움목 (Halanaerobiales)1.1.2.3. 테르모아나이로박테르목 (Thermoanaerobacteriales)1.1.2.4. 나트라나이로비움목 (Natranaerobiales)

1.1.3. 에리시펠로트릭스강 (Erysipelotrichi)

1.1.3.1. 에리시펠로트릭스목 (Erysipelotrichales)

1.1.4. 네가티비콕쿠스강 (Negativicutes)

1.1.4.1. 셀레노모나스목 (Selenomonadales)

1.1.5. 테르몰리토박테르강 (Thermolithobacteria)

1.1.5.1. 테르몰리토박테르목 (Thermolithobacterales)

1.2. 방선균문(Actinobacteria)

1.2.1. 방선균강(Actinobacteria)

1.2.1.1. 아키디미크로비움아강(Acidimicrobidae)

1.2.1.1.1. 아키디미크로비움목(Acidimicrobiales)

1.2.1.2. 방선균아강(Actinobacteridae)

1.2.1.2.1. 방선균목(Actinomycetales)1.2.1.2.2. 비피도박테리움목(Bifidobacteriales)

1.2.1.3. 코리오박테리움아강(Coriobacteridae)

1.2.1.3.1. 코리오박테리움목(Coriobacteriales)

1.2.1.4. 코리네박테린아강(Corynebacterineae)

1.2.1.4.1. 미코박테리아목(Mycobacteriaceae)

1.2.1.5. 니트릴리룹토르아강(Nitriliruptoridae)

1.2.1.5.1. 니트릴리룹토르목(Nitriliruptorales)1.2.1.5.2. 에우제비아목(Euzebyales)

1.2.1.6. 루브로박테르아강(Rubrobacteridae)

1.2.1.6.1. 루브로박테르목(Rubrobacterales)1.2.1.6.2. 테르몰레오필룸목(Thermoleophilales)1.2.1.6.3. 솔리루브로박테르목(Solirubrobacterales)

2. 그람음성균(Gram-negative bacteria)

2.1. 녹만균문(Chloroflexi)2.2. 이상구균-서열균문(Deinococcus-Thermus)

2.2.1. 데이노콕쿠스강(Deinococci)

2.2.1.1. 데이노콕쿠스목(Deinococcales)2.2.1.2. 테르무스목(Thermales)

2.3. 남세균문(Cyanobacteria)2.4. 열탈유간균문(Thermodesulfobacteria)2.5. 산수균문(Aquificae)2.6. 열포균문(Thermotogae)2.7. 프로테오박테리아문(Proteobacteria)

2.7.1. 알파프로테오박테리아강(Alphaproteobacteria)

2.7.1.1. 로도스피릴룸목(Rhodospirillales)2.7.1.2. 리케차목(Rickettsiales)2.7.1.3. 아출세균목(Hyphomicrobiales)

2.7.2. 베타프로테오박테리아강(Betaproteobacteria)

2.7.2.1. 부르크홀데리아목(Burkholderiales)2.7.2.2. 네이세리아목(Neisseriales)

2.7.3. 감마프로테오박테리아강(Gammaproteobacteria)

2.7.3.1. 장내세균목(Enterobacteriales)2.7.3.2. 비브리오목(Vibrionales)2.7.3.3. 프세우도모나스목(Pseudomonadales)2.7.3.4. 레지오넬라목(Legionellales)2.7.3.5. 크산토모나스목(Xanthomonadales)2.7.3.6. 파스테우렐라목(Pasteurellales)2.7.3.7. 티오트릭스목(Thiotrichales)

2.7.4. 델타프로테오박테리아강(Deltaproteobacteria)2.7.5. 입실론프로테오박테리아강(Epsilonproteobacteria)

2.7.5.1. 캄필로박테르목(Campylobacterales)

2.7.6. 제타프로테오박테리아강(Zetaproteobacteria)

2.8. 스피로헤타문(Spirochaetes)

2.8.1. 스피로헤타강(Spirochaetales)

2.9. 피브로박테르균문(Fibrobacteres)2.10. 녹색유황세균문(Chlorobi)2.11. 의간균문(Bacteroidetes)2.12. 클라미디아균문(Chlamydiae)

2.12.1. 클라미디아강(Chlamydiales)

2.13. 우미균문(Verrucomicrobia)2.14. 부유균문(Planctomycetes)2.15. 아키도박테리움균문(Acidobacteria)2.16. 크리시오게네스균문(Chrysiogenetes)2.17. 탈철간균문(Deferribacteres)2.18. 푸소박테리움균문(Fusobacteria)2.19. 겜마티모나스균문(Gemmatimonadetes)2.20. 니트로스피라균문(Nitrospirae)2.21. 시네르기스테스균문(Synergistetes)

2.21.1. 시네르기스테스균강

2.21.1.1. 시네르기스테느균목

2.22. 딕티오글로무스균문(Dictyglomi)

2.22.1. 딕티오글로무스균강

2.22.1.1. 딕티오글로무스균목

2.23. 렌티스파이라문(Lentisphaerae)

2.23.1. 렌티스파이라목2.23.2. 빅티발리스목2.23.3. 올리고스파이라목

3. 분류 불명

3.1. 테네리쿠테스문(Tenericutes)

3.1.1. 몰리쿠테스강 (Mollicutes)

3.1.1.1. 아콜레플라스마목 (Acholeplasmatales)3.1.1.2. 아나에로플라스마목 (Anaeroplasmatales)3.1.1.3. 엔토모플라스마목 (Entomoplasmatales)3.1.1.4. 할로플라스마목 (Haloplasmatales)3.1.1.5. 미코플라스마목 (Mycoplasmatales)

세균역(細菌域, Bacteria)은 세포 소기관을 갖지 않는 원핵생물을 포함하는 분류다.

뒤에 '(☠)'가 붙은 항목은 인간에게 병원성을 가진 종류.

1. 그람양성균(Gram-positive bacteria)

그람양성균은 그람염색법을 시행하였을 때 보라색으로 염색되는 세균으로 세포벽의 80~90%가 펩티도글리칸(Peptidoglycan)으로 구성되어있어 염색약의 영향을 많이 받고, 크리스탈 바이올렛 염색약과 펩티도글리칸 간의 복합체가 생성되어 탈색제와 대조염색약의 영향도 거의 받지 않아 결과적으로 크리스탈 바이올렛의 색상인 보라색으로 염색된다.

그람양성균은 DNA의 시토신(Cytosine)과 구아닌(Guanine)의 함량에 따라 높은 G+C함량의 그람양성균과 낮은 G+C함량의 그람양성균으로 나뉘는데, 높은 G+C 함량의 그림양성균에는 방선균류가 포함되며, 낮은 G+C함량의 그람양성균에는 후벽균류와 테네리쿠스(학자에 따라서는 후벽균류에 포함시키기도 한다)가 포함된다.

1.1. 후벽균문(Firmicutes)

대표적인 낮은 G+C 함량을 지닌 그람양성균으로 사람의 장내 미생물의 대부분을 차지하는 균류이다. 비만인 사람은 장내 후벽균류의 비중이 높다는 연구 결과가 존재한다.

1.1.1. 간균강(Bacilli)

1.1.1.1. 간균목(Bacillales)

간균과(Bacillaceae)

간균속

낫토균

포도상구균과(Staphylococcaceae)

포도상구균속(☠)

황색포도상구균

메티실린 내성 황색 포도상구균
반코마이신 내성 황색 포도상구균(VRSA)

표피포도상구균
부생성포도상구균

파이니바킬루스과(Paenibacillaceae)

브레비바킬루스속

파이니바킬루스속

인삼세균뿌리썩음병균

리스테리아과(Listeriaceae)

리스테리아속

리스테리아 모노사이토제네스(☠)

1.1.1.2. 유산균목(Lactobacillales)

유산균과(Lactobacillaceae)

유산균속

연쇄상구균과(Streptococcaceae)

락토코쿠스속

락토코쿠스 락티스

연쇄상구균속

장내구균과(Enterococcaceae)

장내구균속(☠)

엔테로코쿠스 파이칼리스
엔테로코쿠스 파이키움

1.1.2. 클로스트리디움강 (Clostridia)

1.1.2.1. 클로스트리디움목 (Clostridiales)

클로스트리디움과(Clostridiaceae)

클로스트리디움속(Clostridium)

펩토스트렙토콕쿠스과(Peptostreptococcaceae)

클로스트리디오이데스속

디피실리균(☠)

헬리오박테리아과(Heliobacteriaceae)

1.1.2.2. 할라나이로비움목 (Halanaerobiales)

1.1.2.3. 테르모아나이로박테르목 (Thermoanaerobacteriales)

1.1.2.4. 나트라나이로비움목 (Natranaerobiales)

1.1.3. 에리시펠로트릭스강 (Erysipelotrichi)

1.1.3.1. 에리시펠로트릭스목 (Erysipelotrichales)

에리시펠로트릭스과(Erysipelotrichidae)

에리시펠로트릭스속

돼지단독균(☠)

1.1.4. 네가티비콕쿠스강 (Negativicutes)

1.1.4.1. 셀레노모나스목 (Selenomonadales)

1.1.5. 테르몰리토박테르강 (Thermolithobacteria)

1.1.5.1. 테르몰리토박테르목 (Thermolithobacterales)

1.2. 방선균문(Actinobacteria)

방선균류는 토양에 균사 같은 뿌리를 내리거나 포자를 만들어 초기에는 진균류와 세균의 중간 단계의 생물체로 여겨졌으나, 현재는 유전자 분석을 통하여 DNA에 GC함량이 높은 그람양성균으로 분류된다. 항생제인 악티노마이신과 스트렙토마이신과 반코마이신은 해당 균류에 속한 그람양성균에서 만들어진다.

1.2.1. 방선균강(Actinobacteria)

1.2.1.1. 아키디미크로비움아강(Acidimicrobidae)

1.2.1.1.1. 아키디미크로비움목(Acidimicrobiales)

1.2.1.2. 방선균아강(Actinobacteridae)

1.2.1.2.1. 방선균목(Actinomycetales)

미크로코쿠스아목(Micrococcineae)

미크로코쿠스과(Micrococcaceae)

사르키나속

사르키나 루티아

클라비박테르속

쿠르토박테리움속

잎쪼김병균

브레비박테리아과(Brevibacteriaceae)

브레비박테리아속

브레비박테리움 리넨스

코리네박테리움과(Corynebacteriaceae)

코리네박테리움속

디프테리아균(☠)

프로피온산균과(Propionibacteriaceae)

프로피온산균속(Propionibacterium)

여드름균(☠)

방선균과(Actinomycetaceae)

감자더뎅이병속

감자더뎅이병군

1.2.1.2.2. 비피도박테리움목(Bifidobacteriales)

1.2.1.3. 코리오박테리움아강(Coriobacteridae)

1.2.1.3.1. 코리오박테리움목(Coriobacteriales)

1.2.1.4. 코리네박테린아강(Corynebacterineae)

1.2.1.4.1. 미코박테리아목(Mycobacteriaceae)

미코박테리움속[1]

결핵균(☠)
나균(한센병균)(☠)

1.2.1.5. 니트릴리룹토르아강(Nitriliruptoridae)

1.2.1.5.1. 니트릴리룹토르목(Nitriliruptorales)

1.2.1.5.2. 에우제비아목(Euzebyales)

1.2.1.6. 루브로박테르아강(Rubrobacteridae)

1.2.1.6.1. 루브로박테르목(Rubrobacterales)

루브로박테르과(Rubrobacteraceae)

루브로박테르속

루브로박테르 라디오톨레란스

1.2.1.6.2. 테르몰레오필룸목(Thermoleophilales)

1.2.1.6.3. 솔리루브로박테르목(Solirubrobacterales)

2. 그람음성균(Gram-negative bacteria)

그람음성균은 그람염색법으로 염색하였을 때 붉은색으로 염색되는 세균으로, 세포벽에 펩티도글리칸(Peptidoglycan)층이 적어 크리스탈 바이올렛 염색약의 영향을 거의 받지 않고, 탈색제에 영향을 많이 받는 리포다당(Lipopolysaccharide)층이 존재해 탈색되어 후에 처리하는 대조염색약에 영향을 받아 붉은색으로 염색된다.

2.1. 녹만균문(Chloroflexi)

2.2. 이상구균-서열균문(Deinococcus-Thermus)

2.2.1. 데이노콕쿠스강(Deinococci)

2.2.1.1. 데이노콕쿠스목(Deinococcales)

데이노콕쿠스과(Deinococcaceae)

데이노콕쿠스속

데이노콕쿠스 라디오두란스

2.2.1.2. 테르무스목(Thermales)

테르무스과(Thermaceae)

테르무스속

테르무스 테르모필루스

2.3. 남세균문(Cyanobacteria)[2]

2.4. 열탈유간균문(Thermodesulfobacteria)

2.5. 산수균문(Aquificae)

2.6. 열포균문(Thermotogae)

2.7. 프로테오박테리아문(Proteobacteria)

2.7.1. 알파프로테오박테리아강(Alphaproteobacteria)

2.7.1.1. 로도스피릴룸목(Rhodospirillales)

로도스피릴룸과(Rhodospirillaceae)

마그네토스피릴룸속

마그네토스피릴룸 마그네토탁티쿰(자석박테리아)

초산균과(Acetobacteraceae)

초산균속

2.7.1.2. 리케차목(Rickettsiales)

리케차과(Rickettsiaceae)

리케차속(☠)

오리엔티아속(☠)

쯔쯔가무시균

아나플라스마타과(Anaplasmataceae)

아나플라스마속(☠)

아나플라스마 파고사이토필라

2.7.1.3. 아출세균목(Hyphomicrobiales)

근류균과(Rhizobiaceae)

근류균속

2.7.2. 베타프로테오박테리아강(Betaproteobacteria)

2.7.2.1. 부르크홀데리아목(Burkholderiales)

알칼리게네스과(Alcaligenaceae)

아조히드로모나스속

아조히드로모나스 라타

알칼리게네스속
보르데텔라속

백일해균(☠)

부르크홀데리아과(Burkholderiaceae)

코마모나다과(Comamonadaceae)

옥살로박테르과(Oxalobacteraceae)

양송이무름병균

랄스토니아과(Ralstoniaceae)

가지과풋마름병균

2.7.2.2. 네이세리아목(Neisseriales)

네이세리아과(Neisseriaceae)

네이세리아속

임질균(☠)
수막구균(☠)

2.7.3. 감마프로테오박테리아강(Gammaproteobacteria)

2.7.3.1. 장내세균목(Enterobacteriales)

장내세균과(Enterobacteriaceae)

대장균속(☠)[8]

O157

프로테우스속

프로테우스 불가리스

이질균속(☠)

지하적리균

엔테로박테리아속

엔테로박테르 클로아카이(☠)

살모넬라속(☠)

예르시니아속(Yersinia)(☠)

펙토박테리움속

펙토박테리움 카로토보룸

플레시오모나스속

플레시오모나스 시겔로이데스

엔테로벡터속

잎갈색점무늬병

화상병균속

무름병균속

판토에아속

벼내영갈변균

브레네리아속

2.7.3.2. 비브리오목(Vibrionales)

비브리오과(Vibrionaceae)

비브리오속(☠)

2.7.3.3. 프세우도모나스목(Pseudomonadales)

프세우도모나스과(Pseudomonadaceae)

프세도모나스속

모락셀라과(Moraxellaceae)

아키네토박테르속

아키네토박테르 칼코아세티쿠스

모락셀라속

모락셀라 라쿠나타

2.7.3.4. 레지오넬라목(Legionellales)[9]

레지오넬라과(Legionellaceae)

레지오넬라속(☠)

콕시엘라과(Coxiellaceae)

콕시엘라속(☠)

콕시엘라 버네티

2.7.3.5. 크산토모나스목(Xanthomonadales)

크산토모나스과(Xanthomonadaceae)

크산토모나스속

2.7.3.6. 파스테우렐라목(Pasteurellales)

파스테우렐라과(Pasteurellaceae)

악티노바킬루스속
파스테우렐라속

파스테우렐라균(☠)

하이모필루스속

하이모필루스 인플루엔자(☠)

2.7.3.7. 티오트릭스목(Thiotrichales)

티오트릭스과(Thiotrichaceae)

티오마가리타속

2.7.4. 델타프로테오박테리아강(Deltaproteobacteria)

2.7.5. 입실론프로테오박테리아강(Epsilonproteobacteria)

2.7.5.1. 캄필로박테르목(Campylobacterales)

헬리코박테리아과(Helicobacteraceae)

헬리코박테르속

위나선균(헬리코박테르 필로리)(☠)

2.7.6. 제타프로테오박테리아강(Zetaproteobacteria)

2.8. 스피로헤타문(Spirochaetes)

2.8.1. 스피로헤타강(Spirochaetales)

스피로페타과(Spirochaetaceae)

트레포네마속

매독균(☠)

2.9. 피브로박테르균문(Fibrobacteres)

2.10. 녹색유황세균문(Chlorobi)

2.11. 의간균문(Bacteroidetes)

2.12. 클라미디아균문(Chlamydiae)

2.12.1. 클라미디아강(Chlamydiales)

클라미디아과(Chlamydiaceae)

클라미디아속

클라미디아 트라코마티스(☠)

클라미도필라속(Chlamydophila)

2.13. 우미균문(Verrucomicrobia)

아크케르만시아 무키니필라(Akkermansia muciniphila)

2.14. 부유균문(Planctomycetes)

2.15. 아키도박테리움균문(Acidobacteria)

2.16. 크리시오게네스균문(Chrysiogenetes)

2.17. 탈철간균문(Deferribacteres)

2.18. 푸소박테리움균문(Fusobacteria)

2.19. 겜마티모나스균문(Gemmatimonadetes)

2.20. 니트로스피라균문(Nitrospirae)

2.21. 시네르기스테스균문(Synergistetes)

2.21.1. 시네르기스테스균강

2.21.1.1. 시네르기스테느균목

2.22. 딕티오글로무스균문(Dictyglomi)

2.22.1. 딕티오글로무스균강

2.22.1.1. 딕티오글로무스균목

2.23. 렌티스파이라문(Lentisphaerae)

2.23.1. 렌티스파이라목

2.23.2. 빅티발리스목

2.23.3. 올리고스파이라목

3. 분류 불명

그람 양성균도 그람 음성균도 아닌 세균.

3.1. 테네리쿠테스문(Tenericutes)

세포벽이 없다는 특징 때문에 계통적 위치가 불확실하였으나 유전자 분석을 통해 그람 양성균과 밀접한 관계가 있다고 여겨지고 있다. 계통학적으로 후벽균류와 연관이 깊고, 학자에 따라서는 후벽균류의 일종으로 취급하기도 한다.

3.1.1. 몰리쿠테스강 (Mollicutes)

3.1.1.1. 아콜레플라스마목 (Acholeplasmatales)

파이토플라스마

3.1.1.2. 아나에로플라스마목 (Anaeroplasmatales)

3.1.1.3. 엔토모플라스마목 (Entomoplasmatales)

3.1.1.4. 할로플라스마목 (Haloplasmatales)

3.1.1.5. 미코플라스마목 (Mycoplasmatales)

미코플라스마 혹은 마이코플라스마는 세포벽에 펩티도글리칸이 전혀 없는 특징을 보인다.

미코플라스마과(Mycoplasmataceae)

미코플라스마속(☠)

[1] 미코플라스마와는 전혀 다른 속이다.[2] 엽록체도 이곳에 속한다.[3] 리케차두창(rickettsialpox)의 원인균.[4] 부톤네즈열(boutonneuse fever)의 원인균.[5] 발진티푸스의 원인균.[6] 발진열의 원인균이다.[7] 로키산 홍반열의 원인균.[8] 단 모든 대장균이 병원성을 가지지는 않는다.[9] 라틴어식 발음으로는 레기오넬라목.