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- 모든 경기는 왼쪽 팀이 홈 팀이다.
1. 1라운드
- 팀 분포
- 챌린저스리그: 8팀
- U리그: 7팀
- R리그: 1팀
| 포천시민축구단 (C) | 울산대학교 (U) |
| 2 | 0 |
| 춘천시민축구단 (C) | 고려대학교 (U) |
| 1 | 2 |
| 서울 유나이티드 (C) | 한남대학교 (U) |
| 2 | 4 |
| 이천시민축구단 (C) | 홍익대학교 (U) |
| 3 | 2 |
| 청주 직지 FC (C) | 아주대학교 (U) |
| 3 | 1 |
| 성균관대학교 (U) | 서울 FC 마르티스 (C) |
| 8 | 0 |
| 부천 FC 1995 (C) | 경찰 축구단 (R) |
| 0 | 4 |
| 양주시민축구단 (C) | 동국대학교 (U) |
| 3 | 1 |
챌린저스리그 4팀, U리그 3팀, R리그 1팀이 2라운드 진출에 성공했다.
2. 2라운드
- 팀 분포
- 내셔널리그: 5팀
- 챌린저스 리그: 5팀
- U리그: 3팀
- R리그: 1팀
| 용인시청 축구단 (N) | 경찰 축구단 (R) |
| 0 | 4 |
| 목포시청 축구단 (N) | 성균관대학교 (U) |
| 5 | 1 |
| 김해시청 축구단 (N) | 양주시민축구단 (C) |
| 1 (5) | 1 (4) |
| 청주 직지 FC (C) | 안산 H FC (N) |
| 1 | 0 |
| 한남대학교 (U) | 경주시민축구단 (C) |
| 1 (4) | 1 (5) |
| 이천시민축구단 (C) | 충주 험멜 (N) |
| 0 | 2 |
| 고려대학교 (U) | 포천시민축구단 (C) |
| 4 | 2 |
내셔널리그 3팀, 챌린저스리그 2팀, U리그 1팀, R리그 1팀이 32강에 진출하였다.
3. 32강
- 모든 경기는 5월 23일에 치러진다.
- 팀 분포
- K리그: 16팀
- 내셔널리그: 12팀
- 챌린저스 리그: 2팀
- U리그: 1팀
- R리그: 1팀
| 포항 스틸러스 (K) | 청주 직지 FC (C) |
| 4 | 0 |
| 인천 유나이티드 (K) | 김해시청 축구단 (N) |
| 3 | 0 |
| 강원 FC (K) | 고려대학교 (U) |
| 1 | 0 |
| FC 서울 (K) | 목포시청 축구단 (N) |
| 3 | 0 |
| 수원 삼성 블루윙즈 (K) | 강릉시청 축구단 (N) |
| 5 | 2 |
| 전남 드래곤즈 (K) | 창원시청 축구단 (N) |
| 1 | 0 |
| 성남 일화 천마 (K) | 수원시청 축구단 (N) |
| 5 | 1 |
| 상주 상무 피닉스 (K) | 울산 현대미포조선 돌고래 (N) |
| 2 | 1 |
| 제주 유나이티드 (K) | 인천 코레일 (N) |
| 2 | 1 |
| 전북 현대 모터스 (K) | 천안시청 축구단 (N) |
| 3 | 1 |
| 부산교통공사 (N) | 경남 FC (K) |
| 2 (4) | 2 (5) |
| 부산 아이파크 (K) | 고양 KB국민은행 (N) |
| 0 | 1 |
| 울산 현대 축구단 (K) | 대전 한국수력원자력 (N) |
| 1 | 0 |
| 대구 FC (K) | 경찰 축구단 (R) |
| 3 | 1 |
| 충주 험멜 (N) | 광주 FC (K) |
| 2 | 4 |
| 대전 시티즌 (K) | 경주 시민축구단 (C) |
| 2 | 1 |
K리그 vs 하부 리그 구도로 진행되어, 부산 아이파크를 제외한 모든 K리그 팀이 16강에 진출하였다.
4. 16강
- 모든 경기는 6월 20일에 치러진다.
- 팀 분포
- K리그: 15팀
- 내셔널리그: 1팀
| 경남 FC (K) | 강원 FC (K) |
| 1 | 0 |
| 전북 현대 모터스 (K) | 전남 드래곤즈 (K) |
| 1 | 0 |
| 제주 유나이티드 (K) | 대구 FC (K) |
| 2 | 0 |
| 성남 일화 천마 (K) | 울산 현대 축구단 (K) |
| 1 | 2 |
| FC 서울 (K) | 수원 삼성 블루윙즈 (K) |
| 0 | 2 |
| 인천 유나이티드 (K) | 고양 KB국민은행 (N) |
| 2 (3) | 2 (4) |
| 대전 시티즌 (K) | 상주 상무 피닉스 (K) |
| 2 (4) | 2 (2) |
| 포항 스틸러스 (K) | 광주 FC (K) |
| 3 | 1 |
고양 KB국민은행이 내셔널리그의 자존심을 지킨 가운데, 슈퍼매치에서는 수원이 승리를 거두었다. 대체적으로 강팀이 약팀을 상대로 승리를 획득한 모양새이다.
5. 8강
- 모든 경기는 8월 1일에 치러진다.
- 팀 분포
- K리그: 7팀
- 내셔널리그: 1팀
| 포항 스틸러스 (K) | 전북 현대 모터스 (K) |
| 3 | 2 |
| 대전 시티즌 (K) | 제주 유나이티드 (K) |
| 1 | 2 |
| 경남 FC (K) | 수원 삼성 블루윙즈 (K) |
| 1 (4) | 1 (3) |
| 울산 현대 축구단 (K) | 고양 KB국민은행 (N) |
| 6 | 1 |
6. 준결승
- 팀 분포
- K리그: 4팀
| 포항 스틸러스 (K) | 제주 유나이티드 (K) |
| 2 | 1 |
| 울산 현대 (K) | 경남 FC (K) |
| 0 | 3 |
7. 결승
- 팀 분포
- K리그: 2팀
7.1. 스코어보드
| 2012 대한축구협회 FA컵 결승전 | ||||||||||||||||||||
| 10월 19일 | ||||||||||||||||||||
| 포항스틸야드 | ||||||||||||||||||||
| | VS | |||||||||||||||||||
| 포항 스틸러스 | 경남 FC | |||||||||||||||||||
| K리그 | K리그 | |||||||||||||||||||
| 1 | 0 | |||||||||||||||||||
| 박성호 (119') | ||||||||||||||||||||
| 중계방송사: | ||||||||||||||||||||
8. 우승
| 2012 하나은행 FA컵 우승 |
| |
| 포항 스틸러스 |
| 3번째 우승 |
MVP: 황지수