스타워즈: 배드 배치/줄거리

클론 전쟁의 로고가 사라지며 배드 배치 로고가 나타나며 후속작임을 밝힌다.분리주의 연합은 벼랑 끝에 몰리고 공화국 군은 은하 전역에서 승리를 거둔다. 제다이 기사단이 펠퍼틴 의장의 납치를 저지하자. 그리버스 장군은 은하계 외곽으로 후퇴한다. 드로이드군은 크게 패했으나 그리버스는 치열하게 반격한다.
공화국군의 클론 부대는 칼러에서 분리주의 잔당들과 전투를 벌인다. 제다이 마스터 빌라바의 지휘 아래 클론 부대는 저항하면서 버틴다. 제다이 케일럽은 지원 부대를 기다리는데 이때 나타나는게 클론 포스 99(배드 배치). 드로이드 부대를 전멸시킨 배드 배치의 테크는 그리버스 장군이 오비완 케노비에 의해 격퇴될 임박점에 있다 말한다. 케일럽이 배드 배치와 함께 하고 진격하는 도중 펠퍼틴이 오더 66(Order 66)[2] 실행을 명령한다. 이어 클론들을 펠퍼틴의 명령에 따르게 된다. 케일럽은 다시 돌아가 마스터를 구하러 가고 배드 배치도 동일한 명령을 받았으나 효과는 없었다. 크로스헤어는 이때부터 의심가는 행동을 하는데 오더 66에 따라 케일럽을 저격하고 케일럽은 도망친다. 클론 부대는 제다이가 반역을 저질렀다며 제다이른 공격하고 있고 배드 배치(크로스헤어 제외)는 이에 의문을 품는다. 케일럽은 제다이의 능력으로 크로스헤어를 쓰러트리고 낭떠러지에서 헌터를 만났지만 건너가 버린다. 헌터는 뒤쫓아온 크로스헤어에게 케일럽이 낭떠러지에서 떨어져 죽었을거라 말한다.
배드 배치가 카미노로 돌아가는 도중 크로스헤어는 케일럽의 죽음에 의문을 품은 채 헌터에게 사실을 묻는다. 숙소에 도착한 크로스헤어는 헌터가 케일럽을 풀어 줬음을 밝힌다. 에코가 오랫동안 일해 온 클론들의 배신이 이상하다고 하자 테크는 일반병의 프로그램 때문이라 한다. 카미노족은 대신 배드 배치의 유전자를 조작해 각 캐릭터에 특별한 능력을 부여해줬고 일반병인 에코는 스카노 마이노에서 입은 부상 때문에 기존의 일반병 프로그램이 삭제됐고 수치 상으로 기계에 가깝기 때문이라고 말한다.
클론들이 모인 집회에서 펠퍼틴이 공화국을 제1은하제국으로 바꾸겠다고 천명하자 클론들은 환호한다. 테크는 클론들이 환호하자 그들이 조종당하고 있지 않느냐 하고 집회를 나와 제다이 섬멸이 가장 중요하다고 말한다.(오더 66에 영향을 받지 않는데 제다이를 적대시 한다는 점이 이상함. 번역이 잘못된 건지 모르겠음) 이때 뒤를 따르는 소녀 하나를 발견하는데 그 소녀가 오메가. 오메가는 이들이 클론 포스 99이며 각각의 구성원 이름을 알고 있다. 이때 나타난 날라 세는 오메가를 데려간다.
카미노에 등장한 타킨 제독은 팰퍼틴의 말을 빌어 전쟁이 끝났으니 클론의 필요성이 줄었다고 말한다. 카미노 수상은 계약에 따라 클론 생산을 지속해야 한다 하지만 제독은 그 계약은 이전 공화국 시기의 계약으로 은하 제국 하에서는 의미없다 한다. 수상은 제국이 불안정하기 때문에 클론 부대가 필요하다고 하고 제독은 징병제를 실시하면 비용이 반으로 준다고 말한다. 전투력과 효율성이 징집병 보다 우수하다고 하지만 제독은 그 판단은 자신이 한다고 말한다.
식사 자리에서 헌터는 제국에서 클론을 점검하고 있다고 말한다. 오메가가 합석하면서 배드 배치가 외톨이라서 좋다고 말한다. 지나가던 클론들이 오메가를 불량품이라 비하 하자 오메가는 얼굴에 빵을 던진다. 곧 배드 배치들이 참여하는 난전이 벌어지는 데 크로스헤어는 빠져 있다가 자신이 맞자 합세한다. 이 광경을 제독과 카미노 수상이 지켜본다. 맞은 에코가 정신을 차린 곳은 의무실. 의무 드로이드는 배드 배치 맴버들이 유전적 결함이 있다고 말한다. 에코는 클론들에 부정적인 타킨 제독이 왔다가 말한다. 수상이 호출했다며 의무실을 나가는 헌터는 오메가에게 자신들과 가까이 지내지 말라고 한다. 수상을 만나러 가던 배드 배치는 훈련장 이동을 통보 받는데 이는 제독이 요구한 것이라 한다.
훈련장에서 제독은 클론들의 효율성과 전투력을 테스트를 통해 증명하라고 한다. 제독은 1차 테스트를 이변 없이 완료하자. 실탄을 지급한 2차 테스트를 진행하라고 한다. 초기에는 실탄에 당하지만 규범에서 벗어난 전술로 2차 테스트를 통과한다. 타킨 제독은 날라 세에게 클론 포스 99 맴버들의 설명을 요구하고 박사는 세포 돌연변이로 군인으로서의 능력이 향상되었다고 말한다. 다섯이 전부이고 수상은 제국의 훌륭한 자산이 될 거라 한다. 타킨은 그들이 오더 66을 수행했는지 의심하고 크로스헤어가 낸 보고서(케일럽 탈출)를 이야기 하며 충성심을 확인하겠다고 말한다.
숙소에서 실탄을 사용한 것에 대한 불만을 표시하던 중 타킨 제독이 들어온다. 제독은 온데론 행성[3]에 있는 반란군 세력을 처리하라고 한다. 출발을 준비하던 중 오메가가 와서 제독이 배드 배치를 해치려 한다고 말한다. 자신도 위험하며 카미노를 떠나겠다고 한다. 배드 배치는 그대로 떠나고 날라 세는 자신의 옆에 있으라고 말한다.
오메론 지구에 도착한 배드 배치는 반란군을 찾았는데 드로이드가 아닌 일반 사람과 아이들이 있어 이상함을 느끼며, 주저하는 사이 반란군으로 짐작되는 사람들에게 포위된다. 반란군들이 모인 자리에서 배드 배치는 이들이 반란군이 아니며 탈영한 공화국 군사임을 알아챈다. 그 자리에서 렉스 함장과 스카이 워커 장군에게 훈련 받은 공화국 군 간부인 쏘우 게레라를 만났다. 그는 클론 펠퍼틴이 황제가 되었기 때문에 발생한 일이며 제다이는 학살 당했고 클론 부대를 손에 넣으면 은하계를 지배할 것이라 말한다. 또한 클론 전쟁은 끝났으나 이미 내전은 시작됐다고 한다. 그는 자리를 이탈하면서 클론이 온데론에서 자기들을 도왔으니 이번엔 기회를 줄 때라 하며 적응하고 살아 남을지 과거와 함께 죽을 지 결정하라고 한다. (이들을 제독이 보낸 감시 로봇이 지켜 보고 있다.)
하보크 머로더로 복귀하던 중 민간인을 죽이라고 명령하는 상부에 회의를 느끼는 다수와 명령은 명령일 뿐 지켜야 한다는 크로스헤어가 대립한다. 헌터는 추적 중인 드로이드를 부수는데 크로스헤어만 다른 의견을 낸다. 헌터는 오메가가 이번 임무와 타킨이 수상했다고 하며 카미노로 돌아오지 말것을 말했다 한다. 테크는 오메가가 제5의 고성능 클론이라고 하자 헌터는 오메가를 데리고 오자고 하고 크로스헤어는 꼬마 하나 때문에 명령을 또 어기자는 거냐며 반발한다. 헌터는 그 애는 우리와 같고 홀로 내버려 둘 수 없다고 크로스헤어에게 말한다. 배드 배치의 숙소에서 몰래 들어간 오메가와 드로이드는 클론 병사들에게 발각되고 드로이드는 파괴되고 오메가는 끌려간다.
기지와 응답이 없었지만 카미노에 도착한 배드 배치는 전술대로 움직이며 오메가를 찾아 다시 이곳에 모이기로 한다. 제독이 나와 정찰 드로이드로 다 보았다며 쏘우 게레라[4]와 공모한 반란죄로 배드 배치를 감방에 넣는다. 감방에는 오메가가 있었고 크로스헤어는 헌터가 약해지는 이유를 설명하라 한다. 헌터가 우리를 갇히게 했고 명령 불복종에 이르게 했다며 화를 낸다. 오메가는 크로스헤어가 하려는 일을 안다며 하지 말라고 권한다. 하지만 클론들은 크로스헤어를 불러 낸다. 날라 세 박사는 크로스헤어의 유전 변형 억제칩이 뇌 활동에 영향을 주고 있고 오더 66의 영향을 받고 있다고 말하자 제독은 프로그램 강화를 명령하고 박사는 프로그램을 실행한다.
감방에 갇힌 배드 배치는 방의 약한 부분을 래커가 치는 방법으로 부수고 오메가를 올려 보내 방을 탈출한다. 크로스헤어가 갇힌 곳을 찾으러 가는 배드 배치는 오메가 격납고에 자신들의 물품이 있다는 사실을 알려주자 그곳에서 장비를 습득하고 자신들을 찾으러 온 개조된 크로스헤어를 만난다. 전투가 벌어지고 크로스헤어는 격납고 문을 닫으려고 하지만 날라 세 박사가 이를 멈춘다. 헌터를 노리던 크로스헤어의 총을 오메가가 맞춰 떨어뜨리고 배드 배치와 오메가는 탈출에 성공한다. 그리고 배드 배치팀은 J-19로 경로를 설정한다.

아낙시스 전투로 인한 공화국의 피로도가 증가해 몰리고 있던 상황. 윈두와 아나킨이 전쟁 상황에 대해 논의하던 중 렉스 대위가 자신의 전략이 적 드로이드쪽에게 빼앗기는 것에 대해 이야기 한다. 그리고 이를 파악하기 위해 적의 사이버 센터를 습격하기로 한다.
숙소에서 렉스는 에코가 나온 사진을 보고 있다. 사령관에게 에코(아크 트루퍼 에코)가 살아있을 수도 있다고 말한다. 사령관은 시타델에서 죽었다고 말하나 렉스는 드로이드가 짜는 전략은 모두 에코와 자신이 만들었던 전략이라고 주장한다. 어떤 분대를 데려갈 거라 말하니 클론 포스 99라고 말한다. 클론 포스 99(이하 배드 배치)의 기체는 시끌벅적하게 항구에 들어오고 사령관은 이들이 싷험용 클론 포스 99이며 결함이 있는 클론이라고 이야기 한다.
이동하는 함선에서 크로스헤어는 일반 애들이랑 함께 일하는게 일을 별로 안해 봐서 쳐다 본다며 이쑤시개를 날린다. 그냥 일반 보병을 말하는 거 라면서 수습하는 헌터, 사령관은 표적은 사이버 센터라 말한다. 이동 중 적 드로이드 들에게 공격을 받아 추락한 건쉽. 사령관이 건쉽에 깔려 있자 래커가 힘을 발휘해 구해낸다. 추락 장소에 적 드로이드들이 물밀 듯 들어오고 헌터는 돌격 작전인 배드배치 82번 충격파 작전을 감행해 물리친다. 적의 작전 드로이드는 이번 작전이 변칙적이라고 하고 사령관은 제다이가 있었는지 묻는다.
야영 중인 팀에서 사령관은 다른 팀이 후송할 것이라 말하는 렉스는 지금부터 지휘권은 자신에게 있다고 말한다. 크로스헤어는 그렇게 좋은 작전이라면 사령관이 자신들을 부른 이유가 뭔지 묻는다. 크로스헤어가 도발하자 다른 클론들이 뛰쳐 나온다. 헌터가 상황을 종료시키고 사령관을 위해 대장의 뜻을 따르겠다고 말한다.
전초 기지를 배드 배치의 돌격 작전으로 빼앗고 사이버 센터의 병력을 알아 본다. 그리고 적의 습격은 계속된다. 적의 사령관은 사이버 센터의 기습을 알고 모든 드로이드들에게 준비 명령을 내린다. 테크가 문을 열기 위해 암호를 풀려 하지만 래커가 발로 차서 들어가고 테크는 중앙 센터에 남고 남은 팀은 일반병을 데리러 간다. 렉스는 알고리즘이 담긴 팩을 주고 프로그램을 찾으라 하는데 테크는 이게 프로그램이 아니라 한다. 이는 스카코 마이노에서 보내는 신호로 CT-1409(에코) 였다.
적의 작전 드로이드는 사이버 센터에서 스카코 마이노와 접촉한 것 같다고 말한다. 비행선에서 테크는 렉스에게 CT-1409가 뭐냐고 물어보고 렉스는 에코의 번호였고 에코가 살아있는 것 같다고 말한다.

참모 본부에서 에코 복귀 작전 시행을 거부할 가능성이 높지만 평의회에서 통과시켜 줄 가능성이 더 높기 때문에 작전은 진행될 것으로 예상되나 다만 우선시 되는 건 전술이 간파되는 이유를 알아내는 것이라고 아나킨이 말한다. 이에 헌터는 함정일 것이라 말한다.(네 동료가 될 사람이다...) 아나킨은 파드메와 비밀 통화를 한다. 아나킨은 렉스가 개인 감정 때문에 이번 작전에 임하는 것 같아 걱정이라고 말하자 파드메도 렉스가 믿어 왔던 것처럼 아나킨도 렉스를 믿으라 한다.
스카코 마이노에 접근 중인 하보크 머로더 주위로 날 짐승 괴물이 날고 렉스는 폴텍이란 종족이 살고 있다고 말한다. 테크가 폴텍족은 날 짐승을 숭배한다고 한다. 아나킨은 검을 놓친 채 괴물에게 끌려가고 헌터가 위치 계산 후 헌터가 연결 선을 쏘아 맞춘 후 헌터가 따라 간다. 헌터가 알려준 위치로 따라온 배드 배치팀. 테크는 통역기를 통해 폴텍족은 싸움 나는 걸 원치 않으며 그래서 지도자를 잡았다고 말한다. 아나킨은 전쟁을 일으킨 건 우리가 아닌 왓 탐보와 분리주의자들이라 함. 렉스는 퍼콜에 우리의 동료가 잡혀 있으니 그 친구를 구하면 여길 떠서 다신 안 온다고 함. 테크족은 자기들이 정찰을 해주고 도시까지 안내해줄 테니 그 다음부턴 알아서 가라고 말한다.
아낙시스의 트렌치 제독은 클론 침투조가 스카고의 알고리즘 신호를 추적했고 스카코 마이노의 장관 작전이 위기에 처한 것 같다고 말한다. 장관은 테크노 연합은 중립이라 괜찮다고 말한다.
아나킨조는 폴텍조의 안내를 받아 근처까지 왔는데 에코의 신호가 없다고 테크는 말한다. 신호가 방해 받았을 수도 있고... 이때 헌터는 위장이며 에코는 죽었을지도 모른다고 말한다. 크로스헤어는 렉스가 이번 작전에 집착하는 이유는 그가 동료를 버렸기 때문이라고 말한다. 일반병이기 때문에... 그러자 렉스의 주먹이 날아든다. 아나킨은 배드 배치조와 렉스를 떼어놓고 렉스에게 에코가 죽었을 가능성도 대비하라고 말한다.
테크는 승강기의 비번을 알아내고 아나킨이 은밀하게 해야한다 했지만 배드 배치팀은 드로이드들을 박살낸다. 아나킨은 에코의 신호가 불규칙적이기 때문에 모든 방을 수색하자고 한다. 신호가 다시 들어와 방을 찾게 되고 장관의 신호가 들어오게 되는데 에코는 이미 죽었다고 말한다. 그리고 드로이드의 습격이 이어지지만 가볍게 순삭. 렉스와 테크가 방어 들어 가고 반쯤 드로이드로 개조된 에코가 꺼내 진다. 렉스는 에코에게 돌아가자고 말한다.

아나킨은 밖의 상황이 나아지기 시작하자 렉스와 테크, 에코 곁으로 간다. 드로이드 군대가 충원되자 점점 더 안으로 좁혀드는 아나킨 팀. 에코가 밖으로 나갈 길을 생각해내고 팀은 그의 말에 따라 로프를 타고 배기구 위로 올라간다. 래커는 가장 마지막에 아나킨의 포스로 끌어올려 진다.테크노 연합의 연구물인 에코와 연구 자산이 파괴되자 장관은 분노한다.
환풍 시설을 통해 탈출하는 아나킨 팀. 에코는 저들이 에코의 뇌를 들여다 본 것처럼 자신도 테크노 연합의 데이터베이스에 접속된 상태였기 때문에 탈출구를 알았다고 말한다.
외나무 다리 같은 길에서 양측의 드로이드 군단을 만난 아나킨 팀. 테크는 원주민들의 파충류 구조 신호를 발생시켜 날 수 있는 파충류를 불러 모아 위기를 해결한다.퍼콜에서 폴텍족 거주지까지 날아온 아나킨팀. 폴텍족은 왜 여기로 돌아왔냐고 묻고 아나킨은 환영 받지 못해서 라고 말하는데 그 때 비행 물체를 탄 드로이드들이 공격을 해온다. 약속을 어겼다고 분노한 폴텍족. 렉스는 에코의 몸을 보여주며 상황이 좋지 않음을 이야기 한다. 테크노 연합은 중립이라 말하지만 그렇지 않다고 말한다.
테크노 연합의 장관은 대군을 보내 이들을 잡으려 하고 삼족 거대 로봇은 공격을 성공시키는 듯 하지만 아나킨과 배드 배치의 활약으로 실패한다. 테크노 연합 정관은 에코의 손실로 큰 위기에 빠졌다고 하고 이 손실을 분리주의자들에게 알릴까 고심하는데 투자금을 만회할 방법을 찾는게 우선이라 한다.

에코가 전투에 관한 회의에 참여하려 하자 렉스가 이를 막는다. 윈두가 들어 보자고 하자 에코는 아낙시스 상공에 있는 분리주의자들의 전함에 접속해 전술을 입력하면 이번엔 자신들이 저쪽의 움직임을 알 수 있다고 말한다. 이륙 준비를 하던 테크는 에코의 정신은 플러그를 뽑기 전까지 적에게 지배당했으니 충성심이 진짜인지 확인할 수 없다 말한다.
적의 함대에 접근하는 아나킨 팀. 에코는 전송을 조작하여 적의 비행정으로 위장해 전함에 착륙한다. 윈두의 제다이 병력이 생산 단지를 공격하고 에코는 통신실에 적들이 접근하지 못하도록 막아달라고 한다. 트렌치 제독은 스카코에 연결해 알고리즘으로 최적의 반격을 계산할 것을 지지한다. 이때 접속에 성공한 에코는 이 같은 내용을 알게 되고 테크는 여기서 정보를 보내면 발각되기 때문에 스카코에서 보낸 것처럼 조작해야 한다고 말한다.
프렌치 제독에게 스카코의 명령이 하달되는데 공화국이 지원 병력을 보내지 않을 것이기 때문에 전병력을 생산 단지로 이동시키라고 한다. 이 같은 상황에 대해 아나킨 팀은 의문을 품는데 에코는 피드백 펄스로 드로이드를 꺼버리면 된다고 말한다. 전장에 점점 드로이드들이 늘어나지만 일시에 꺼진다. 헌터는 이제 진짜 우리편이라 할 수 있겠다고 말하고 에코는 의심할만 한게 있었냐고 되묻는다. 작전 드로이드는 정보의 출처가 이 전함이라는 것을 알아내고 제독은 보안 드로이드를 보내라고 말한다. 그리고 아낙시스에 숨겨 두었던 폭탄을 작동 시킨다. 핵융합로의 폭탄 제거는 윈두가 맡겠다고 내려 간다. 폭탄을 찾았지만 광선 보호막으로 보호 받고 있다. 에코가 번호를 알려주다가 마지막 번호를 앞두고 적의 전산 공격을 받아 쓰러지고 암호는 윈두가 해결해야 한다.
프랜치 제독에게 암호를 빼앗으려는 아나킨. 제독은 아낙시스를 잃으면 어차피 두쿠에게 죽게 될 거라고 말한다. 제다이는 자신을 해치지 못할 거라 하지만 아나킨은 그런 약점은 자신에게 없다며 팔을 잘라 버린다. 결국 암호를 알아내 폭탄은 해체되고 제독은 마지막 한방을 날리지만 아나킨은 한 칼에 제독을 보내 버린다. 그리고 래커가 좋아할 만한 선물도 함께 챙겨 간다. 래커는 대량의 드로이드를 해치워 좋아하지만 크로스헤어는 반사판을 이용한 원샷 多킬로 더 많은 적을 보내 버려 래커를 비웃는다. 아나킨은 폭발 스위치를 래커에게 주고 래커는 버튼을 누르며 좋아한다.
돌아온 배드 배치팀과 렉스팀은 훈장을 받게 되고 배드 배치팀과 렉스팀은 헤어진다. 헌터는 에코에게 일반병들과 안 맞는다는 생각이 들면 자신들을 찾아 오라고 한다. 렉스는 니가 편하게 느껴지는 곳이 있다면 그 곳이 네가 있을 자리라 한다. 에코는 클론 포스 99(배드배치)에 합류 한다.

비행 중 에코는 피곤에 잠든 오메가를 바라보며 헌터와 이야기 한다. 살루카미에 도착한 오메가는 처음으로 카미노에 벗어난 탓에 새로운 자연 환경에 감동한다. 헌터의 친구는 탈영병으로 외부인과의 접촉을 피하고자 살루카미에 살고 있다. 레커가 부비트랩을 건드리고 컷과 수 부부는 배드 배치를 맞이한다. 컷은 클론 부대가 제다이를 배신했다는 말을 렉스에게 들었다고 말한다. 행동 조정에 관한 이야기를 했다는데 이를 오메가는 억제칩이라고 말한다. 억제칩은 카미노족이 클론을 조종하기 위한 목적으로 심었다고 한다.부부의 아이들이 들어오고 오메가는 같이 놀기로 하였으나 적응하지 못한다. 컷은 헌터와 이야기 하며 카미노인은 목적없이 클론을 만들지 않는다고 하지만 헌터는 그냥 어린 아이일 뿐이라고 한다. 그리고 컷은 육아가 드로이드와 싸우는 것보다 어렵다고 말하며 이미 클론 부대가 들어와 있고 여길 떠나는 왕복선의 탑승권을 끊으러 마을로 갈거라고 한다.마을로 내려간 헌터와 컷은 비행선들이 모두 제국군에 의해 압류되는 것을 본다. 계류장에서 구형 크레딧이 등록 번호가 없으면 사용할 수 없게 됨을 알게 된 컷. 등록 번호를 만듦으로써 구화폐를 은하 제국 크리딧으로 교환할 수 있다는 광고가 지나간다.
아이들과 놀던 중 공이 밖으로 나가자 오메가는 아이들의 경고를 무시하고 밖으로 공을 꺼내러 나간다.등록 번호(체인 코드)에 관해 이야기하는 테크와 부부. 수는 등록 번호에 등록하는 순간 컷이 탈영병임이 들킬 것이라고 말한다. 괴물이 오메가에게 다가오고 수는 총을 쏴서 헌터는 칼로 괴물을 쫓아낸다. 오메가를 다그치는 헌터. 컷은 오메가를 감싸 안으며 다쳤는지 확인하고 안아준다. 테크에게 등록 번호 위조를 부탁하는 헌터. 비행선 안에서 머리 장신구를 쥐고 울먹이는 오메가. 헌터는 살루카비를 떠날 때 오메가도 데려가 달라고 이야기 한다. 둘이 그 아이의 가족이 되어 주었으면 한다며. 테크와 에코는 우주선이 버려진 것으로 보인다면 제국군이 공항으로 끌고 갈 것이라고 말한다. 하지만 이때 오메가는 우주선에 타 있는 상태. 테크는 등록 번호를 입수한 다음 공항에서 보자고 하지만 우주선 안에 오메가가 있다는 걸 몰랐던 상태. 테크는 에코를 데이터 복사와 공디스크를 훔치기 위해 보안 상황실로 보낸다. 디스크를 입수한 에코. 하지만 이를 오메가가 가지고 헌터와 컷 부부를 향해 간다. 컷과 수를 만난 오메가 하지만 오메가는 이들을 따르지 않고 배드 배치와 함께 가고 싶다고 말한다. 오메가와 헤어진 헌터. 에코가 기체를 잡고 있는 락커를 해킹하지 못하자 래커가 힘으로 뜯어낸다. 왕복선에 탑승하려는 컷을 클론이 잡지만 비행장에서 전투가 벌어졌다는 말을 듣고 그냥 보낸다. 두 기체 모두ㅡ 행성을 떠나고 기체 안에서 헌터와 에코는 서로가 배워 나가야할 것이 많음을 말한다.

전원 공급과 누워 있는 오메가. 식사 시간이 되자 헌터는 오메가에게 바를 하나 건네 주는데 이를 래커가 먹고 싶어하자 오메가는 먹으라고 준다. 하지만 헌터가 뭐라 하자 다시 오메가에게 돌려주고 헌터는 현재의 상황이 오메가에게 그리 좋지 않다고 말한다. 에코는 살루카비를 떠날 때 기체가 많이 파손되었다고 한다. 테크는 자신들의 인지 기능 억제칩이 작동하는지 파악하는 게 급선무라고 한다. 기체는 하이퍼 스페이스 과정 중 튕겨 나와 달에 착륙한다. 살루카비에서 교전 중 콘덴서가 나가 그걸 교체해야 이륙할 수 있다고 한다. 테크는 재고가 하나 남았다고 했는데 오메가가 박스를 하나 꺼내고 그게 크로스헤어의 무기 세트였다. 일동 어색... 하지만 크로스헤어의 저격을 받은 래커는 아직도 아프지만 그가 보고 싶다고 하고 테크는 인지기능억제칩의 영향이라고 한다. (크로스헤어가 다시 돌아온 시즌 3 4화에 테크는 없다.) 에코는 그게 가능하냐고 묻는데 오메가는 그게 억제칩의 영향이라 말한다. 래커는 그럼 크로스헤어의 잘못이 아니라고 한다. 헌터는 말을 끊고 콘덴서를 찾아 이별을 뜨자고 한다.
날라 세와 타킨 총독이 보는 앞에서 크로스헤어(CT-9904)가 깨어나고 램파트는 등록 번호 시스템이 잘 정착되어 나가고 있다고 칭찬 받는다. 워 맨틀 프로젝트에 대해서 묻자 새로운 사령관 밑에서 최정예 신병들이 훈련 받을 준비가 되어있다고 한다. 램파트는 병력이 많이 필요하다고 하고 날라 세는 크론 시스템으로 맞출 수 있다고 하지만 그는 다른 방법으로도 대응하다고 한다. 그는 클론과 인간들의 제휴를 말한다. 콘덴서를 교체하던 중 에코는 이상한 소리를 듣고 테크와 찾는 동안 에너지를 먹는 종인 오르도 달 드래곤은 콘덴서를 물고 사라진다. 오메가는 분대원임을 밝히며 헌터를 따라 나선다.
카미노 수상은 만들어진 직후부터 훈련을 받는 클론 부대 보다 인간 부대의 전투력이 떨어질 거라 말하고 램파트는 기술 교육은 가르치면 된다고 한다. 타킨 총독은 클론과 인간 병사를 온데론에 보내 클론 프스 99가 실패한 소 게레라 일당을 처리를 테스트 하겠다고 한다.괴물을 찾아나선 헌터와 오메가. 오메가는 자기 의지가 아니었으니 크로스헤어에 화내지 말라고 말한다. 헌터는 동료를 두고 온 자기 자신에게 화가 난다고 말한다. (이게 사실인지는 시즌 3 5화에서 확인 가능할 듯) 오메가를 찾으러 가자고 말하고 헌터는 고개를 끄덕인다.
인간 병사는 클론의 실력이 좋은데 제국이 왜 자기들을 불렀겠냐며 대장 놀음 잘 해보라며 크로스헤어를 극딜한다. 배드 배치와 같은 행성에 투입된 크로스헤어 부대는 소 게레라 부대와 결합하려는 부대를 덮친다. 콘덴서를 찾았으나 이는 미끼였고 헌터는 호흡 마스크가 빠져 의식을 잃는다. 헌터의 총을 보면서 오메가는 결심한다.
크로스헤어는 병사를 죽이고 나머지 민간인들도 죽이려 하자 인간 병사가 군인들은 다 죽었는데 민간인은 왜 죽이냐 크로스헤어를 제지하고 크로스헤어는 민간을 죽이지 말라는 명령은 없었다고 말한다. 그러자 인간 병사들은 우린 군인으로 입대한거지 학살자로 입대한 것이 아니라 하며 크로스헤어의 말을 따르지 않겠다고 한다. 그러자 크로스헤어는 자신이 지휘관이 된 이유는 전달된 명령을 무조건 따르기 때문이라고 말하며 인간 병사를 죽인다. "훌륭한 군인은 명령에 복종한다." 그러자 인간 병사들은 민간인을 학살한다. 오르도 달 드래곤을 따라간 오메가. 서식지에서 콘덴서를 발견하지만 괴물에게 들킨다. 헌터가 깨어나고 오메가는 랜턴을 주고 컨덴서를 가지고 나온다.
귀환한 크로스헤어 부대는 타킨 총독으로 부터 전임 부대가 실패했던 일을 성공했다고 칭찬 받는다. 클론 트투퍼 부대는 비용이 많이 들긴 하지만 당분간은 운영하겠다고 하며 이번 프로젝트는 램파트 제독이 전담하라고 지시한다. 만약 램파트의 계획이 성공한다면 클론이 쓸모 없어질 거라 말하는 카미노 총독은 클론의 효용성을 증명해야 한다고 말한다. 장고 펫(보바 펫의 부친.前 만달로어인 전사이자, 은하계 최고의 현상금 사냥꾼. 모든 클론 트루퍼들의 유전자 제공자)에서 추줄한 유전 물질의 성능이 갈수록 저하되고 있다고 말하는 날라 세. 총독은 유전 물질은 하나만 있으면 충분하다며 클론 포스 99 중 아무나 있으면 된다고 말한다. 방에 칠해진 날짜/혹은 처리한 작전 숫자를 잠깐 본 후 크로스헤어는 생각에 잠긴다.
다시 기체로 돌아온 헌터와 오메가. 기체는 정상 작동하고 머리가 아프다고 빠져 있던 래커는 머로더 내부의 잘 꾸며진 공간을 선물이라며 오메가에게 공개한다. 처음으로 자신 만의 방을 갖게 되었다며 좋아하는 오메가(시즌 3까지 오메가와 래커와의 부녀? 느낌의 관계는 계속 이어진다) 너도 방이 있어야 우리 분대원이야.라고 말하는 헌터.

배드배치는 숨어 있기 위해 아이다 플로어로 가기로 한다. 테크는 연료와 식량 부족을 이유로 못 간다고 하며 보급품은 이제 우리가 구해야 한다고 한다. 에코가 함정의 식별 부호가 수배 목록에 올랐다고 테크는 어디든 착륙해서 변경해야 한다고 한다. 그래서 가까운 행성인 판토라로 가기로 한다. 판도라에 도착한 배드배치는 수리공에게 식별 번호를 무마하는 대가로 돈을 지불했으나 사기 당하고 위치를 추적자에게 노출시킨다.
헌터.에코.오메가는 식량을 구하러 가고 마을에선 살루카미에서 본 등록 번호 홍보 영상을 틀어 놓고 있다. 식별 번호(시그니처)키는 후방 시차 변환기에 내장되어 있어 이를 제거 한다. 드로이드로 위장한 에코를 상인에게 팔 계획을 지닌 헌터. 에코는 가격을 올리라 한다. 이 때 오메가의 위치는 추적자에게 노출되고 길을 잃은 오메가는 추적자의 손을 잡는다. 추적자에게서 블라스터를 발견했지만 호신용이라 거짓말하는 추적자. 헌터에게 발견되는 오메가. 헌터는 그 추적자에게서 떨어지라 말하고 오메가는 자신을 도와준 사람이라 말한다. 추적자는 헌터를 기절시키고 도망친다. 깨어난 헌터는 이를 배드 배치에게 알리고 테크는 중앙 보안 네트워크에 접속해 감시 카메라를 사용하겠다고 하고 수리의 시간 지연은 에코가 드로이드들을 이용해 처리하겠다고 한다. 추적자에게 쫓기던 오메가는 정비 터널로 들어가고 추적자도 따라 들어간다. 레커에게 발견된 오메가. 레커와 추적자는 싸움을 시작한다. 한턴에 정신을 잃은 레커. 스카이타워 옆 타워에 매달린 오메가를 발견한 테크. 위치를 헌터에게 말해주고 이동하는 비행선에 떨어진 오메가와 추적자. 뒤를 따르는 헌터. 오메가는 짐을 떨어뜨려 추적자가 다른 비행선으로 떨어지게 한다. 비행선을 차지한 추적자는 다시 오메가를 쫓고 헌터는 폭탄으로 추적자 비행선을 폭파시켜 따돌린다. 드로이드들의 협조로 비행선을 빠르게 고치고 배드 배치는 판도라를 떠난다.

오드멘털에 가능 도중 크로스헤어의 콤링크를 오메가에게 주는 테크. 그곳에 있는 씨드라는 정보원이 현상금 사냥꾼이 오메가를 쫒는 이유에 대해 알고 싶시 때문. 오메가는 씨드를 쉽게 찾아 내고 씨드에게 추적자를 물어 본다. 그러자 씨드는 배드 배치가 자신의 부탁을 들어주면 정보를 알려 주겠다고 한다. 용병이 된 배드배치. 자이기리아인 노예상에 붙잡혀 있는 무치를 구조하라고 한다. 테크는 나이기리아인 노예 상인들이 오드 멘털에 숨어 있다고 한다. (시리즈 내내 래커는 두통을 호소하는데 이에 대한 이야기의 연결점은 없는 듯) 무치라는 아이가 있는 곳에 내려 무치를 찾은 팀. 오메가에게 기체에서 기다리라는 헌터와 불만을 내비치는 오메가(사실 광선 총이 날아 다니는 배경 속에서 별다른 방어 장비 없이 헤드 기어와 전자 활 정도 차고 다니는 오메가가 이상하긴 하다) 팀은 작전을 전개하기 전 괴물 날짐승에게 털리고 노예상에게 잡힌다. 비행선을 수색하는 노예상을 피해 밖으로 나온 오메가. 노예상 중 1인이 향후 오메가가 가지고 다닐 활을 가지고 있다. 망원경으로 배드 배치가 잡혀 있는 모습을 본 오메가. 오메가는 단독으로 이들을 구하려 가는데 이를 배드 배치가 발견 한다. 오메가는 노예상에 잡히지만 그전에 무치를 우리에서 풀어 주었고 무치는 우리에서 빠져 나와 난동을 부린다. 헌터와 싸우는 노예 상인 우두머리. 이 자는 배드 배치를 스커그라 부른다. 그리고 날짐승 괴물과 무치의 단독 매치. 헌터의 가벼운 두방에 나가 떨어지는 노예 상인. 에코와 노예가 될 뻔한 사람들 그리고 오메가는 도주 중. 도주 중인 오메가는 이후 그의 무기가 될 광선 활을 습득한다. 무치는 꼬리 물기 스킬로 날짐승 괴물에 승리를 거둔다. 무치는 서열에 민감하기 때문에 래커와 싸우게 되고 래커는 승리해 우위에 있게 된다.
자바의 상위 부하가 직접 찾아왔고 오메가는 랭커 무치를 타고 나타난다. 씨드는 추적자인 페넥 쉔드에 대해 알려 준다. 씨드는 페넥 쉔드가 베드 배치를 쫓는 건 그들의 몸값이 상당하다는 것을 의미하고 자신이 입이 무겁다 말한다.(이는 차후 전개를 예지해 준다)

에코에게 레이저 활을 쏘는 방법을 지도 받는 오메가. 씨드가 코렐리아의 해체 공장에 잠입해서 전술 드로이드를 하나 빼오라고 지시한다. 헌터가 씨드와 일을 할 것인지 말 것인지 결정 안했다고 하자 씨드는 당신들도 돈을 벌고 나도 벌고 게다가 뒤를 봐준다고 말한다. 씨드는 팔 힘이 약해서 그런 거라면서 세발을 쏴서 과녁을 다 맞춘다,
오메가가 전술 드로이드가 왜 중요한 거냐고 묻자. 에코는 전술 드로이드는 싸울 수록 우수해지며 그걸 바탕으로 승리했고 테크는 이제 클론이 제국을 위해 싸우니 그들을 이기기 위해 드로이드가 필요해졌다고 말한다. 머로더에서 내린 배드 배치는 전술 드로이드를 해체해 녹이는 시설에 들어 간다. 헌터와 에코, 테크는 드로이드를 찾기로 하고 오메가에겐 표적을 지켜 보라고 한다. 에코는 전술 드로이드가 한기 밖에 남아있지 않다고 말하고 오메가는 드로이드의 머리를 누군가 훔쳐 간다고 한다. 래커는 그가 인부라고 말하는데 (시즌 7-5 트레이스 마르테즈/라파 마르테즈) 오메가가 그 인부(라파)를 잡는다. 라파가 무기를 내려 놓고 이야기 하자고 하자 오메가가 무기를 내려 놓는데 이를 빼앗으려 하자 무기를 발사시키고 레이저 빔이 다른 곳에 맞자 공장은 아수라 장이 된다.인부들이 배드 배치를 발견하고 공장을 폐쇄한다. 보안 드로이드들이 이들을 발견하고 배드 배치는 전투 상황으로 전환한다. 트레이스는 머리를 이미 확보했다며 언니에게 접선 지점에서 만나자고 한다. 드로이드와 부딛혀 머리를 떨어뜨린 라파. 오메가는 이를 줍기 위해 달려 간다. 고소 공포증이 있는 래커지만 긴 거리를 뛰어 넘어 공장을 재가동 시킨다. (래커가 머리를 시즌 내내 머리를 아파하는 이유는 유전 변형 억제칩이 다른 맴버들과 다르게 미미하게 나마 작동하기 때문) 오메가가 컨베이어 벨트에 발이 끼어 드로이드를 녹이는 곳에 빠질 위험에 쳐하자 트레이스는 오메가를 구하고 따라 온 헌터가 이들을 보호한다. 헌터는 트레이스에게 고마움을 전한다. 트레이스는 전술 드로이드를 깨어나가 해 보안 드로이드를 막자고 하는데 전술 드로이드를 우리가 조종하기 때문에 괜찮다고 말한다. 트레이스는 전투 드로이드를 작동 시켜 보안 드로이드를 공격하라고 전술 드로이드에게 지시한다. R7을 타고 공장을 빠져나오는데 래커는 여전히 머리에 통증을 느끼고 있다. 오메가가 의뢰인이 좋아하지 않겠다고 말하자 라파는 전술 드로이드에 담긴 정보가 얼마나 중요한지 알면서 구매자가 누군지 알지도 못하냐고 헌터에게 화를 내자 헌터는 우리는 돈만 받고 넘기면 끝이라고 한다. 트레이스는 제국에 대항하는 쪽에 정보를 주려 했다고 말한다. 라파는 왜 제국군에 있지 않냐고 묻는다. 헌터는 우린 다르다고 한다.
오메가는 자신들이 살고 있는 동네에 놀러 오라고 말하자 오드 멘탈은 위험한 지역이라고 대답하는 트레이스. 헌터는 전술 드로이드가 파괴되기 전 테크가 백업한 전술 드로이드의 정보를 라파에게 넘긴다. 왜 주냐고 묻자 옳은 일을 위해 쓸 것이라 말하는 헌터. 트레이스는 영상 통화를 하는데 배드 배치의 위치를 알고 있다며 모습이 가려진 상대방(통화한 인물은 렉스)에게 말한다.

적기에 쫓기는 배드배치의 머로더. 에코가 하이퍼 드라이브를 복구시키는대로 하이퍼 스페이스를 진입할 수 있었다. 씨드의 사무실에 도착 후 래커와 오메가는 외출을 한다. 씨드 앞으로 달린 멘탈 믹스의 가격도 상당해 헌터가 씨드의 장부 내역을 확인 후 놀라는데 이는 래커와 오메가가 과자를 먹은 값이었다. 씨드의 사무실로 찾아온 렉스. 테크는 렉스가 제국의 기록에는 전사했다고 나온다고 말한다. 배드 배치의 위치는 마르테즈 자매의 말로 알게 되었다고 한다. 오메가와 래커가 들어오고 오메가는 렉스가 1세대임을 알아본다. 여전히 래커는 두통을 심하게 느끼는데 렉스는 배드 배치가 칩을 제거 하지 않았음을 알게 된다. 테크는 이 칩이 자신들의 이상성 때문에 작용하지 않고 크로스헤어만 예외였다고 말하지만 렉스는 그 칩을 통제될 수 있는 물건이 아니기 때문에 경계해야 한다고 말한다.
렉스와 브라카에서 만나기로 한 헌터. 래커는 계속 머리를 만지며 계획에 불만을 표시한다. 제다이의 순양함에 들어선 배드배치팀. 헌터는 물가에 접근하지 말라고 경고한다. 렉스는 도움을 받아 억제칩을 제거할 수 있었다고 말한다. 고소 공포증이 있는 래커는 밧줄 다리를 간신히 건너다가 아래로 떨어지는데 호수 아래에는 수중 괴물이 있어 래커를 낚아 채 가지만 배드배치 팀의 구조로 간신히 위험을 벗어난다. 의무실에 도착해 수술 준비를 하는데 래커가 이상 반응을 보이기 시작한다. 오더 66을 위반하고 있다며 테크를 목 졸라 던지고 배드배치 팀을 공격한다. 오메가를 공격하려 던 래커는 렉스의 기절 모드 총으로 수술대에 눕게 된다. 수술을 마치긴 하나 의식이 돌아오지 않고 오메가는 옆을 지킨다. 래커가 깨어나고 이전의 일에 대해 사과한다. 오메가는 괜찮다며 멘탈 믹스를 건넨다. 제국과 여전히 싸우는 렉스. 헌터에게 동참하자고 하나 헌터는 오메가도 지켜야 하고 대원들을 위해 최선의 선택이 무엇인지 고민 중이라고 말한다. 고철 업자가 헌터를 발견해 칩입자로 제국에 보고한다.

크로스헤어는 브라카의 순양함에 클론포스 99가 있다는 보고를 램파트 제독에게 하는데 그는 발견 즉시 제거하라는 명령을 한다.
래커는 오메가에게 연막탄으로 열폭탄 해체 방법을 교육시키고 고철상들의 감시를 파악한 에코와 래커는 이들을 모두 제거(기절)한다. 헌터는 수송함 내의 무기만 갖다 팔아도 시드의 빚을 정리할 수 있다고 말하는 데 에코는 우리가 군인이지 무기밀매상은 아니라고 말한다. 테크는 함교로 가서 내부 데이터를 빼내 오고 헌터는 무기를 찾으러 떠난다. 래커는 양자 어뢰 더미를 발견하고 오메가는 함교로 간다. 에코는 렉스 대장과 함께 했다면 시드에게 빚질 일도 없었을 것이라 말한다.(에코 이탈의 스포일러) 헌터는 대장의 길을 우리와 다르다고 한다. 함교에서 오메가는 근접 센서가 작동하는 것을 보고 곧이어 제국군의 함선들이 머리 위로 날아간다. 카미노의 총독 라마 수는 제국군의 브라카 작전의 자신들의 계획에 위협이 되고 있으며 오메가를 현상금 사냥꾼을 통해서라도 빨리 데려오는 게 맞다고 말한다.
크로스헤어의 도착을 확인한 헌터. 테크가 통신을 도청해서 움직임을 파악하려 한다. 크로스헤어가 격납고쪽으로 몰라는 도청을 듣고 포 갑판쪽으로의 이동을 계획하는 헌터. 하지만 통신을 도청해서 자신들의 움직임을 알아내는 방법은 이미 크로스헤어가 눈치 채고 있었다. 테크는 에코에게 예비 전력이 포로 흐르게 재설정해달라고 한다. 포가 발사되면 함판의 전체가 무너질거라 말하는 에코. 반역자들이기 때문에 쫓는다는 크로스헤어. 인지 기능 억제칩이 크로스헤어를 제어하고 있다고 말하는 헌터와 오메가. 전력이 함판 위로 공급되고 포가 발사되자 아수라장이 된다. 이때를 틈타 배드배치팀은 이온 엔진실로 간다. 이온 엔진실을 빠져 나오던 중 크로스헤어의 기습 공격을 받는 배드배치. 크로스헤어가 엔진을 가동시키자 엔진 주변에 폭발물을 설치해 엔진을 떨어뜨리려는 계획을 세우고 작전 대로 탈출에 성공한다. 하지만 케드 베인이 등장해 헌터는 대결 중 쓰러지고 오메가는 케드 베인에게 끌려간다.

꽃게섬에서 오메가의 활약 덕분에 임무를 완수한 배드 배치. 시드의 사무실에서 해적 피와 만난다. 피가 소개한 목적지는 두쿠 백작의 옛 본거지인 캐슬 세레노.시드는 제국이 두쿠 백작의 근거지에서 남은 전쟁 자금을 모두 회수하기 전에 일부라도 털어 오라고 한다. 제국의 눈을 피해온 활동을 해온 헌터는 다시 제국의 영역에 들어가기 싫었지만 시드는 이번 일만 성공시키면 평생 숨어살 돈이 생긴다고 유혹한다. 헌터는 오메가를 바라본다. 에코는 카미노에서 오메가를 구한 일은 옳지만 더 많은 일을 하기 위해 더 많은 자금이 필요하다고 말한다.
궤도 폭격을 당한 도시에 들어선 배드 배치. 전쟁 자금이 실려 있는 컨테이너에 헌터를 제외한 4인조가 오르고 오메가는 전쟁 자금의 목적이 우리와 유사한 것 아니냐 묻는데 에코는 그 전쟁 물자를 어떻게 쓰느냐에 달려 있다고 말한다. 클론 경비병들이 레커가 처리한 경비 트루퍼가 응답이 없음을 확인하자 헌터는 폭발 장치를 부착해 놓은 호위선들을 폭파시킨다. 경비 트루퍼들은 모든 컨테이들을 잠그고 이륙 준비를 하는데 다른 배드 배치들은 컨테이너 안에 갇힌다. 이들은 탈출 포드 쪽으로 가기 위해 이동하지만 트루퍼들은 탈출 포드를 모두 버린다. 이때 시작 때 헌터와 함께 비행선 암기 공부를 하던 오메가는 4급 화물선 컨테이너에는 재진입 추진기가 있음을 테크에게 말하고 화물 컨테이너로 탈출하면 된다고 한다. 하지만 공격이 시작되고 전쟁 자금이 담긴 박스를 버린다. 래커와 헌터는 공격을 받지만 래커는 하단의 탈출로를 힘으로 누르면서 탈출에 성공한다.

재진입 추진기의 작동으로 추락의 위기에서 벗어난 배드 배치. 헌터, 레커조는 폐허를 엄폐물 삼아 머로더로 갈 계획이고 삼림 지대 위쪽에 추락 중인 테크. 에코. 오메가조는 절벽에서 떨어지기 직전에 멈춘다. 하지만 결국 아래로 추락하게 되고 상자에 테크는 다리를 다친다. 트루퍼들은 도시로 이동한 헌터조 찾는 데에 주력한다. 헌터는 무전기 사용을 금하는 00 계획 실행을 명령한다. 오메가는 이들을 훔쳐 보던 노인을 찾았는데 일단 노인의 거주지로 이동하기로 한다.
트루퍼 대장은 방사형 수색 계획을 세워 배드 배치를 사로 잡을 계획을 세운다. 헌터와 레커는 분리주의자들의 탱크가 트루퍼 숙영지를 향하고 있음을 알아차린다. 오메가는 컨테이너의 전쟁 자금을 회수하러 가자고 하지만 노인은 그런 돈 필요없다면서 오메가에게 화를 낸다. 탱크를 확인하러 간 헌터와 래커의 위치가 트루퍼들에게 발각되고 할아버지는 종족의 삶이 담긴 데이터 코드를 고치려고 한다. 테크는 분리주의 역사라 폄하하지만 할아버지는 세레노의 역사라 말한다. 랭커는 배터리 팩으로 공중 지원기와 트루퍼들에게 공격을 퍼붓는다. 테크는 할아버지의 데이터 코드를 복원하고 오메가가 사라진 것을 발견한다. 밧줄을 이용해 컨테이너로 내려간 오메가. 따라간 에코는 공격을 받아 컨테이너에 갇히게 된다. 떨어지는 위기에도 오메가는 전쟁 자금을 포기하지 않는다. 자신 때문에 배드 배치가 평범한 삶을 살지 못 하는 거라 말한다.
할아버지는 테크를 깨운 뒤 할아버지는 에코팀을 구하기 위한 밧줄을 내리고 테크는 건쉽 처리를 맡는다. 머로더가 도착하자 할아버지는 오메가에게 별 장식품을 준다. 오메가는 전쟁 자금을 잃은 것에 대한 아쉬움을 말하지만 에코는 오메가를 데려온 것은 옳은 선택을 했다고 말한다. 트루퍼의 부대장은 클론 포스 99가 살아있다고 말하지만 상관은 모두 티포카 시티에서 죽었다고 한다. 타킨 총독이 상관의 실수를 알면 자신의 위험에 처하기 때문이라고 말하며 클론 포스 99 이야기를 빼고 보고서를 작성하도록 지시한다. 하지만 부대장이 조작할 수 없다고 하자 제독은 부대장을 죽인다.

데식스에 제국의 제독이 도착하고 데식스의 총독 토니 에임스가 맞이한다. 제독은 총독을 대신하려고 왔다고 말한다. 그러나 제독은 드로이드를 통해 총독에 총을 겨누고 거부한다. 잠을 이루지 못하는 크로스헤어. 식당에선 클론 트루퍼들이 방위군 징병 법안에 관해 이야기 한다. 클론은 그 법안이 통과되지 않아야 자신들이 살 수 있을거라 말한다. 크로스헤어가 자리에 앉자 자리를 피하고 크로스헤어는 램파트 제독의 호출을 받는다. 램퍼트는 크로스헤어가 카미노에서 쓰러져 오랜 시간 누워 있었는데도 왜 복귀했느냐 묻자 크로스헤어는 제국의 군인이기 때문이라고 답한다. 제독은 그의 충성심과 결단력을 칭찬하고 분리주의자 영역인 데식스 행성에서 그로튼 총독을 구하는 임무를 맡긴다. 코디 사령관과 한팀이 된 크로스헤어. 오더 66에 반항하는 제국군이 늘고 있다고 하자 제다이처럼 반역자라고 답하는 크로스헤어. 데식스 행성에는 전투 드로이드들이 무장하고 청사를 장악하고 총독을 인질로 잡고 있다고 말하는 데식스 총독은 우리가 자유를 얻으면 제독을 풀어 주겠다고 한다. 데식스 제공팀은 코디 사령관의 비행기를 격추시킨다. 하지만 코디와 크로스헤어 몇몇의 병사는 살아남아 전진하지만 분대원의 반이 죽었다. 코디. 전투 드로이드들을 만난 크로스헤어는 포신 안으로 총을 쏴 탱크를 폭파시킨다. 크로스헤어는 성 위의 드로이드들을 저격하고 코디팀은 쉽게 안으로 진입한다. 전술 드로이드가 작전을 지시하고 총독은 제독을 데리러 간다. 크로스헤어가 드로이드에게 잡히자 코디는 칼을 던져 그를 구한다. 코디가 퍽을 던지고 크로스헤어는 퍽의 표면이 비친 전술 드로이드를 맞춘다. 총독인 토니 에임스는 제독을 인질로 잡고 적법한 총독이라고 하며 제국이 말하는 평화는 거짓이라 한다.
코디는 자신의 무기를 거두고 피를 흘리지 않고도 해결할 수 있다 말한다 이에 넘어간 총독이 제독을 풀어주자 제독은 총독을 사살하라고 말한다. 총독은 평화가 쉽지 않다고 말하고 크로스헤어가 총을 쏴 사살한다. 총독은 시체를 광장에 전시하라 명한다. 많은 생각을 하는 코디. 코디는 새로운 제국. 우리가 더 나은 은하계를 만들고 있냐고 크로스헤어에게 묻는다. 전투 드로이드들과 클론과 다른 점은 스스로 결정하고 선택할 수 있다는 것이라고 말한다. 그리고 이를 가슴에 품고 살아야 하고...
크로스헤어는 또 잠을 이루지 못한다. 식사 중 램파트의 호출을 받는다. 다른 작전에 다른 지휘관이 선임되자 코디는 탈영했다 말하는 램파트. 크로스헤어 주변의 클론들이 자꾸 사라진다고 말한다.

시드가 새로운 임무를 준다며 오메가와 레커. 테크에게 말하며 레커에게 경호를 맡긴다고 한다.
사파 토마에 도착한 테크는 왜 경호가 필요한지 알겠다고 말한다. 시드는 테이-오가 자신의 레이서라고 말하고 테이-오는 우승을 한다. 서로 만난 자리에서 테크는 드로이드 테이오를 경계한다. 밀레기가 등장해 시드를 도발하고 시드는 내기에 응한다.1위와 3위의 작전으로 2위인 테이-오의 기체가 파손되어 경기에 실격한다. 오메가는 다음 판돈을 2배로 올리고 우리가 이기면 시드를 내버려 두라는 딜을 걸고 밀레기는 이를 받아들인다.경주는 내일, 시드는 담보로 잡힌다. 래커는 그냥 밀레기를 처리하자 하는데 시드를 데리고 탈출한다 해도 보복하러 올거라며 말린다. 테크는 미심쩍은 일로 배드배치를 부른게 이번이 처음이 아니라고 말하며 이런 문제가 반복되고 있다고 한다. 밀레기는 시드와 한잔하며 배드배치들도 시드의 실체를 알게 될거라 말한다. 시드는 밀레기를 노려 보며 너의 예상과는 다를 거라 한다.
테이오는 경기에 관한 자신의 주장을 이야기 하던 중 경기의 참여한 레이서의 차에 치여 사망한다. 밀레기는 레이서가 없으니 몰수패라고 하지만 테크가 선수로 뛴다고 말한다. 경기 중 한바퀴를 돌며 속도가 느리다며 무기를 제거하는 테크. 죽음의 터널을 통과해 거리를 좁힌다. 1위와 3위는 이전 경기에서 써먹은 방법을 또 써먹지만 이번에는 테크가 빠져 둘 사이에 문제가 생기고 테크가 우승한다. 밀레기가 배드 배치를 보면서 너희들의 의리를 인정하마 (지난 경기 우승자가 총을 집으려는 것을 제지하며) 하지만 시드도 그럴 것이라 기대하지 말라고 경고한다. 뒤를 조심하라고... (결과적으로 맞는 이야기 였다)

폐기장에 예비 압축기를 찾으러 온 배드 배치. 시드의 사무실에서 해적인 피 지노아와 만나 물건을 감별한다. 오메가가 주워온 물건이 나침반인 걸 알아낸다. 좌표의 위치는 칼다르 트라이너리 태양계, 피가 벌인 상황에 배드 배치가 넘어가고 피와 함께 보물을 찾으러 나선다. 테크는 사람이 살 수 없는 땅이라 말하고 에코도 부정적이다. 나침반이 활성화되자 모두들 의아해 한다. 남쪽을 가르키자 오메가가 나선다. 막다른 길에 도착하자 안으로 들어가자는 피. 에코가 돌을 치우자 길이 열린다. 배드 배치가 안으로 들어가자 지켜보던 누군가가 움직인다.
무늬로 만들어진 돌을 돌리자 부비 트랩이 작동하여 죽을 뻔한 피와 래커. 랜턴에 나침반을 비추자 빛나는 무늬가 나타나고 이를 근거로 돌을 움직이자 개방된 문이 나타난다. 오메가가 산의 심장이 무엇이냐 묻자 피는 진귀한 결정석이라 말한다. 이때 괴물이 래커를 덮치고 총을 쏴 물러가게 한다. 일행과 헤어진 피 팀은 계속 보물을 향해 가자고 한다. 헌터가 빠지자 갈고리를 발사하는데 이 갈고리를 피가 잡아 다시 올라온다. 오메가가 나침반을 넣자 굴이 돌아 가고 피 팀은 앞을 향해 나간다.
테크.에코.레커팀은 통신 장애를 겪고 다시 피 팀과 만난다. 피가 문을 열자 안에 산의 심장이 있고 피가 산의 심장을 뽑자 내부가 음각된 모양이 빛을 발하면서 움직이고 산은 거대한 기린 모양 형태로 변하며 주변을 파괴한다. 테크는 다시 산의 심장을 돌려 놔야 한다고 말하고 피는 싫다고 한다. 좌표를 입력하던 기계는 기계화된 산의 빔을 맞고 사라지고 내부에선 이전에 나온 괴물과 싸우는데. 오메가가 창문을 쏘자 래커가 밖으로 던진다. 오메가와 테크가 산의 심장을 기계에 꽂아 넣자 기계는 작동을 멈춘다. 산의 심장이 녹으며 기계도 해체되고 배드 배치는 불탄 기계 밖을 나온다.
헌터가 그 기계가 작동될 일이 없다고 하자 피는 우리가 여기에 온게 잘한 일이라고 한다. 또 오메가에게 썰을 푸는 피에게 헌터가 장난하는 거냐고 묻는다.

밀수꾼 뱅가드 액시스를 만나러 온 배드 배치. ID 카드 위조품을 건내준다. 오메가는 기지를 탐험하던 중 뱅가드 엑시스 종족이 털 난 종족을 괴롭히는 것을 보고 멈추라 말하지만 그 쪽은 끼어들지 말라고 한다. 리더가 뒷 통수를 치겠냐고 말하고 우키(추바카와 같은 종족)는 자기 고객이 사겠다고 했으니 여기서 떠나면 건드리지 않겠다고 한다. 그때 우키가 제다이 능력으로 검을 빼앗아 들고 전투가 시작되고 배드 배치는 행성을 탈출 한다.
머로더(하보크 머로더) 안에서 우키가 배드 배치를 경계하자 테크는 클론들이 제다이 학살을 명 받았기에 당연한 반응이라고 한다. 헌터는 자신들은 그런 클론과는 다르다고 말한다. 우키족은 자신의 이름이 건지라고 대답한다. 오메가는 고향으로 가고 싶어하니 데려다 주자고 한다. 종족의 본거지인 카쉬크에 데려다 주기로 하지만 이미 제국군이 상주해 있고 그 아이는 제다이라서 어디라도 위험할 거라고 말한다.
카쉬크에 도착한 배드 배치. 거미줄을 치우차 거미 괴물이 달려 드는데 건지는 우리가 해치지 않으면 그들도 신경 쓰지 않는다고 말한다. 건지가 포스를 쓰자 거미 괴물들도 물러 간다. 마을이 있는 곳으로 가자 불탄 집이 보이고 헌터는 탱크 흔적을 보고 제국군이 여길 지나갔다고 한다. 타투인 3대 범죄 조직 중 하나인 트랜도샨이 제국군의 탱크를 몰고 우키족을 끌고 가는 모습이 테크의 망원경에 잡힌다. 트랜도샨은 우키 종족의 석각을 불태우고 있다. 갑자기 건지가 나가 트랜도샨을 상대하고 어쩔 수 없이 배드 배치도 끼어 든다. 땅을 파서 번지는 불을 막은 배드 배치. 우키 종족의 리더인 야나를 만난 배드 배치. 제국군과 트랜도샨이 전투의 흔적을 보고 제다이가 출현했다고 생각한다. 사령부에 먼저 보고해야 한다고 클론이 말하지만 트랜도샨 리더는 자신이 먼저 찾은 다음 그러라고 한다.
우키 종족과 모인 자리에서 헌터는 트랜도샨이 우키 종족이 카쉬크 행성의 자원을 쓸어 가고 있다고 한다. 제국군의 군대가 오고 있다고 하자 야나는 여기서 빨리 떠나라 하지만 에코는 우키족은 우리의 동맹이었기 때문에 우리가 뭐라도 해야 한다고 한다. 출전을 앞두고 나무에게 기도 하는 우키족. 호송대가 가까이 오자 건지는 나무가 작전을 세웠다고 말한다. 둥지로 유인하는 배드 배치팀. 건지가 트랜도샨 리더를 유인하고 우키족이 나무를 치자 거미 벌레가 트랜도샨 용병들을 덮친다. 화염 방사기를 들고 싸우는 트랜도샤족. 거미 괴물이 트랜도샨족을 감싸고 거미줄로 묶어 둥지로 데려 간다. 불이 크게 번지자 헌터는 테크에게 우키족을 전부 모으라고 하고 삽으로 불의 근원지만을 감싸 불을 끈다. 야나는 언젠가 우리 모두 새길을 찾을 거라고 말한다.헌터는 전쟁에서 멀리 떨어진 길이었으면 한다고 대답한다.

술집에서 클론 2명이 램파트 제독의 거짓말에 대해 이야기 한다. 자신들의 고향 카미노를 우리 손으로 파괴했다고 절망하는 클론. 램파트가 그걸 은폐하는 이유에 대해 되묻는다. 클론 케이드는 램파트에게 메시지를 보내 의회에서 말하라고 했다며 안 그러면 자신이 말하겠다고 한다. 술집 밖을 나와 클론은 저격병에게 죽고 클론 슬립은 스피터 바이크를 타고 탈출한다.
의회에서는 카미노 이후 클론을 대체할 만한 방안에 대해 토론한다. 램파트 제독의 방위군 징병 법안이 그 방안으로서 토의된다. 중간과 외곽 은하에서는 반란군들이 많기 때문에 법안이 필요하다는 의원. 베일 오가나 의원은 클론 부대가 배치된 건 분리주의 위기 당시 팰퍼틴 의장이 제안한 비상 지휘권 때문이었으며 이런 군대를 충성을 맹세하는 시민의 군대로 전환하는 건 이 법안의 취지를 위배하는 것이라 말한다. 그리고 황제가 불참하는 이유에 대해 메스 아메다 의원에게 묻는다. 추치 의원은 이해를 말하는 관계에 클론들이 빠져 있음을 지적한다. 그들은 우리를 위해 희생했는데 우리가 그들을 버리는 건 안된다고 말한다. 램파트 제독은 그들에 대한 보상안을 논의할 용이가 있다고 한다. 오가나 의원은 그 방안이 마련될 때까지 법안의 상정과 결정을 미루도록 요청한다. 아메다 의원은 반대하던 누군가가 카미노 사건을 파고 들기 시작한다면 이 법안이 좌초될 것이며 그로 인해 제독도 무사하지 못할 것이라 말한다. 램파트는 추치 의원에게 요구안을 만들도록 하고 의원의 요구안이 상정되기 전에 법안을 승인하면 된다고 말한다.
클론들과 대화를 나누는 추치. 하지만 클론들은 추치의 연급 계획 같은 방안을 거부하고 반란군과 싸우고 싶다고 말한다. 나이가 들면 어떻게 할거냐고 묻자 말이 없어지는 클론들. 자신들은 그러한 걸 생각하지 않도록 훈련받았다고 말한다. 자신들의 요구를 모아 램퍼트 제국의 방안에 담겠다고 말하는 추치 의원. 클론 슬립은 다른 클론들이 나간 후 추치 의원에게 카미노의 진실에 대해 말한다. 카미노는 폭풍으로 파괴된 것이 아니라 램파트가 공격 명령을 내려 파괴된 것이라고. 자신이 램파트가 타고 있던 베나타 전함에 타고 있었다고 말하는 슬립. 그걸 알리려던 클론은 모두 제거되었다고 말한다. 행성을 빠져 나가려는 슬립
추치는 램파트 제독에게 클론의 연금과 새로운 군대에 들어갈 자금은 모두 제국이 마련해야 한다고 말한다. 그리고 카미노의 폭풍에서 어떻게 살아남았으냐고 묻자 자신은 외부 세계에서 훈련에 참석 중이었다고 말한다.
추치에게 들어온 보안 통신을 따라 나가자 오가나 의원이 기다리고 있다. 램파트 제독과 말을 나눈 것이 소득이 있었냐고 묻자 자신의 요청을 받아들였다고 말하는 추치. 오가나는 클론의 권리 문제는 부차적인 것이며 사방에서 반란이 일어나고 있으며 그 수가 크기 때문에 황제는 두려워 하고 있다고 말한다. 카미노에 클론 시설이 파괴되어 황제의 새로운 군대가 등장한 길을 터줬다고 한다. 추치는 한 클론을 만났는데 제독이 카미노 공격을 지시했다고 말했다고 한다. 그 클론이 의회에서 증언해주면 좋을 텐데 말하지만 오가나는 그 클론은 제국도 찾고 있을 거라고 말한다. 램파트는 저격병에게 추치 의원이 그를 만나는 순간 의원도 함께 처리하라고 명령한다.
슬립을 만나 의회 증언을 부탁하는 추치. 하지만 슬립은 이미 케이드가 죽었고 의원도 위험하다고 한다. 추치는 카미노의 클론 시설뿐만 아니라 도시 전체가 몰살당했다고 말한다. 그때 죽은 클론과 사실을 밝히려다 죽은 클론을 위해 정의를 실현해야 한다고 말하는 추치. 슬립을 중앙 시스템에 백업해 놓은 함교의 사령 일지를 보라고 말한다. 그리고 저격병의 총을 맞고 죽는다. 가드들은 다 죽고 저격병이 추치에게 다가 왔을 때 렉스 대위가 추치를 구한다. 저격병을 잡아 심문하려 했지만 난 신봉자다라는 말만 하고 저격병은 자살한다.

무료한 시간을 보내는 배드배치팀. 코러산트로 오라는 렉스의 호출. 테크는 코러산트는 은하계의 수도이자 제국의 심장이라고 말한다. 배드배치팀을 맞이하는 랙스 대장과 추치 의원. 렉스는 식별 번호가 지워진 저격병 시체를 보여주며 표적은 클론이었던 슬립이었다고 한다. 죽인 이유는 의회가 램파트 제독에게 속아 카미노가 폭풍 때문에 파괴된 것이라 알고 있지만 슬립은 진실을 목격했고 의원은 그를 의회에 세우려 했지만 살해 당했다. 배드 배치도 현장에 있었지만 탈영병이라는 신분 때문에 받아들여지지는 않을 것이다. 남은 방법은 베나터에 기록된 램파트의 사령일지로 이것을 백업 데이터 뱅크에 저장해 놓은 함선이 현재 정비창에서 수리 중이기 떄문에 빼올 수 있고 내일 방위군 징병 법안이 통과되기 때문에 시간이 얼마 없다.
의회에 오메가를 데려간 추치는 아직 클론을 군사 자산으로만 보는 시각이 있지만 자신이 은하 시민들과 동등한 권리를 가질 수 있게 바꾸려고 노력 중이라고 말한다. 베일 오르가나가 메시지를 보내 할리 버토리와 연결시켜 준다. 추치는 지난 1년간 카미노 작전에 배정되었다가 사라진 의회 충당금에 대해 말해 달라고 한다. 알지 말아야 할 것을 알려하면 어떻게 되는지 남은 카미노인들은 소수라 더 이상 중요하지 않다고 말하는 버토리. 오메가는 자신도 클론이며 자신의 고향이 파괴되는 것을 목격했기 떄문에 화가 난다고 한다. 자신은 공격이 임박했다고 의심했지만 총리인 라마 수는 오만했으며 그는 제국이 클론을 필요로 할거라 생각했다고 말한다. 자금을 유용한 것은 램파트가 맞지만 결정적인 증거가 없이는 힘들거라 한다.
정비창에 도착한 배드배치. 광선 방어막은 테크가 없애고 탈것을 타고 운항실로 이동한다. 데이터 이관 작업을 하려면 전원을 켜야 하는데 그러면 보안팀이 곧 출동할 거라 말하는 테크. 보안팀이 움직이고 데이터 백업에 성공하자 탈출 포드를 통해 탈출구로 이동한다.
의회에선 램파트가 징병 법안의 투표를 서두르는데 오메가가 백업 데이터를 오르가나에게 넘기고 이를 받은 오르가나가 다시 추치에게 전달하여 의회에 램파트의 베나터와 클론 전함들이 티포카시를 공격하는 영상이 상영된다. 하지만 이때 팰퍼틴이 의회에 등장하고 메스 아메다는 사적인 욕심으로 카미노로 공격한 것으로 보고 그를 체포한다. 팰퍼틴은 이는 제독 혼자 벌인 일이 아니며 이는 제독 휘하의 클론들이 맹목적으로 명령을 따라 학살을 감행한 것이다. 따라서 이 법안은 우리의 미래이며 이 법률을 통해 제국 스톰 트루퍼[5]가 전초가 될 것이라 말한다.
렉스는 팰퍼틴은 언제나 자신들 보다 한발 앞서 있다고 말하며 자책한다. 추치는 클론이 동등한 권리를 얻을 자격이 있으며 자신은 포기하지 않을 것이라 말한다. 에코가 렉스 대장과 함께 하겠다고 하자 팀은 행운을 빌어 준다. (배드배치팀은 팀원이 잠시 빠지든 죽음으로 하차하든 감정이 없다. 인간적인 감정은 오메가와 에코 만이 지니고 있는 듯)

오메가가 잡혀 있는 탄티스 기지에서는 에머리가 실험체들을 대상으로 혈액 샘플을 체취하고 있고 이는 오메가도 마찬가지. 날라 세의 혈액 샘플 연구소에 간 오메가는 자신의 혈액 샘플을 박사에게 건네지만 박사는 오메가의 안전을 이유로 이를 파기한다. 제국은 M(Midi-Chlorian) 수치 유전자를 재생산하려 하고 있지만 표본 샘플에서는 의미있는 결과를 얻지 못했다. 동물 사육실에서 배처와 만난 오메가는 자신이 가져온 과자를 넣어주며 배처를 순응화시킨다.
실험체 감방에서 크로스헤어(CT-9904)와 만난 오메가는 자신의 탈출 의사를 밝히지만 크로스헤어는 부정적인 입장이다. 동물 사육실에서 배처(LH-201)가 꼬리에 상처를 입은 걸 발견한 오메가는 K-9X1에게 치료해달라고 말하지만 의료 드로이드가 아니라는 이유로 거부당한다. 오메가는 치료 도구를 이용해 상처를 치료해 준다. 이를 크로스헤어와 이야기 나누지만 그는 배처와 자신은 잊고 탈출에만 신경을 쓰라고 한다. 하지만 오메가 그를 버리고 탈출하는 일은 없다고 말한다. 다음날 불시 점검 때 개인 물품이라는 이유로 오메가의 짚 인형을 빼앗아 간다.
오메가와 친해진 배처를 앞에 두고 K-9X1은 길들여졌다는 이유로 배처의 폐기를 말한다. 이때 오메가는 자신이 가진 기기를 조작해 K-9X1의 머리 위로 큰 금속 박스를 떨어뜨리고 K-9X1의 머리를 전기봉으로 감전시켜 보내 버린다.배처를 탈출시키자 마자 햄락과 에머리에게 발각되고 날라 세가 자신을 해치면 협조를 거부할 거라 하지만 햄락은 대신 크로스헤어를 죽이겠다고 말한다. 방에서 침울해져 있는 오메가에게 에머리는 짚 인형을 가져다 준다.

범죄 조직 내 최고위 직을 맡고 있는 듀랜드에게 가문을 모독한 파이크를 넘기고 햄락 박사가 있는 기지의 위치를 얻어 낸다. 주어진 정보를 바탕으로 기지를 찾았으나 이미 궤도 폭격을 통해 파괴된지 시간이 지난 상태였다. 헌터와 래커는 이탈한 클론 소년들을 만나고 소년 목스에게 오메가를 찾고 있다고 말한다. 소년 스택이 기지까지 따라가기로 하고 기지에서 스택이 자료를 옮기던 도중 괴물들을 만나 고전한다. 남은 두 소년은 배드 배치가 타고 온 비행체를 타고 떠나려 하다가 오메가의 인형을 발견하곤 마음이 움직인다. 고전 중이던 배드 배치와 스택 위로 비행체가 도착하고 이들을 이를 타고 탈출에 성공한다. 데이터 패드에 담긴 자료에는 정확한 위치가 담겨 있지 않았고 헌터는 세 소년들을 파부에 데려다 주겠다고 말한다.

오메가가 피를 뽑고 난 후 도착한 햄락과 날라 세. 햄락은 기지에 귀빈이 온다고 하면서 자기 대신 실험실을 맡아줄 것은 명령한다. 날라 세는 혈액 검사를 자신이 하겠다고 하였으나 박사에 의해 거부당하고 혈액 샘플은 연구실로 옮겨진다. 날라 세는 오메가에게 혈액 샘플 검사를 완료하면 위험해질 것이기에 자신의 데이터 패드로 기지를 탈출하라고 말한다.
연구실에서 자신의 혈액 샘플이 검사 기기에 옮겨지는 것을 확인한 오메가는 날라 세의 데이터 패드를 가지고 연구실을 빠져나간다. 펠퍼틴이 기지에 도착하고 햄락은 네크로멘서 프로젝트 때문에 그가 왔다고 말한다. 크로스헤어가 수감된 감방에 찾아간 오메가는 크로스헤어에게 경비병의 주위를 끌어달라고 말하자 순식간에 경비병 둘을 제압한 크로스헤어.날라세가 데이터 패드를 통해 셔틀을 찾으라 했고 자기는 크로스헤어를 두고 갈수 없었다고 말하는 오메가. 셔틀이 황제 것만을 제외하고 이륙할 수 없음을 확인하자 추락한 셔틀에 타기로 하고 거기에 부착된 통신기로 헌터에게 자신의 위치를 알릴 수 있다고 말한다.
햄락은 펠퍼틴 황제에게 충분한 시간과 자원만 주어진다면 M 수치를 복제할 수 있을 거라 말한다. 동물 사육실로 간 둘은 K-9X1을 처리하고 배처의 사육장 뒤편으로 탈출하려는 도중 카르를 만났으나 크로스헤어가 총을 쏴 제압(수면 모드)한다. 펠퍼틴이 떠나는 도중 햄락은 과학부 장관직을 요구하고 황제는 때를 기다리라고 한다. 방어막이 작동되기 전 기지를 탈출한 둘은 수색 비행정의 경로를 따라 가기로 한다. 햄락은 루카(살인 사냥개) 세마리를 풀어 추적을 지시하고 탈출을 날라 세가 도와준거라 말하고 그녀를 가둔다. 추락한 비행정을 발견한 오메가는 기체가 정상 작동하지 않음을 비관하는데 크로스헤어는 자신들을 추적하단 비행체가 다가오자 실망하지 말라 한다. 72번 작전을 수행하기로 한 오메가는 케이블을 타고 기체에 올라 가려는 도중 자신을 습격하려는 적을 만났으나 배처가 이를 돕고 조종석에 앉은 오메가는 포를 쏴서 땅에 있는 적들을 제압한다. 배처를 태우고 이륙한 그들은 조준 장치에 걸려 빠져 나갈수 없었는데 오메가의 혈액 검사 결과를 받아든 카르는 M 수치 유전자가 손상되지 않고 복구 되었음을 햄락에게 알리고 햄락은 공격 명령을 중지시키고 오메가와 크로스헤어가 빠져나가게 놔둔다. 제국의 자원을 마음껏 쓸수 있음을 자신하며...

카미노를 탈출한 오메가와 크로스헤어는 기체의 통신 장비 고장으로 헌터에게 연락하지 못하고 셔틀의 파손으로 이름 모를 행성에 추락한다. 동쪽에 공항이 확인된다며 이동하자는 크로스헤어. 카미노의 수감 시설에 날라 세는 수감되어 있고 햄락이 만나러 온다. 햄락은 오메가와 CT-9904(크로스헤어)이 탈출했음을 알리고 에머리(카)가 검사한 오메가의 혈액 샘플에서는 M 수치 이전이 양성으로 나왔다며 오메가가 다시 잡혀 오면 확인할 수 있을 거라 말한다.
행성의 마을에는 트루퍼들이 있고 크로스헤어는 단순 순찰대라고 한다. 오메가는 헌터에게 연락할 방법을 찾아보자고 하지만 크로스헤어는 장거리 통신은 감청 중이라 위험하다고 한다. 시장에서 옷을 훔친 오메가. 크로스헤어는 작전을 바꿔 직접 공항으로 가자고 한다. 오메가는 블라스터를 쓰지 않는 방법을 보고 배우라고 한다. 오메가는 직원을 매수하려 하지만 비용이 꽤 나가 당황한다. 급전을 마련할 방법을 찾았다는 오메가와 그를 쳐다보는 과일 팔던 소년. 임시 자금 조달법을 설명하는 오메가.
도박에서 큰돈을 따지만 때 마침 트루퍼들이 들어 온다. 트루퍼 상관은 자리를 뺐어 오메가에게 게임을 제안하고 동시에 그들이 타고 온 셔틀이 발각 된다. 게임은 오메가가 이기지만 벌금 1만 크레딧을 낸다. 지켜보던 소년에게 버처의 행방을 듣고 5천 크레딧을 준다. 배처가 있는 하역장은 공항과 반대 위치. 크로스헤어는 후회할 거라 말한다. 크로스헤어에게 당신 혼자 가라면서 돈 가방을 던지는 크로스헤어. 하지만 내 능력 낭비라고 말하며 오메가를 따라 온다.
제국군 대장은 이미 햄락이 보낸 전문을 확인했고 둘이 타고 온 셔틀이 그 탈출자임을 알고 있었다고 말한다. 그러자 오메가는 돈 가방을 대장에게 던지고 크로스헤어 방식대로 하라고 한다. 오메가는 컨테이너 안의 동물들을 모두 풀어주고 하역장은 난장판이 된다. 크로스헤어는 오메가에게 버처와 함께 셔틀 시동을 걸라고 말한다. 대장은 풀린 컨테이너안의 우주 오징어에 잡혀 안으로 끌려 들어간다. 추락한 셔틀에 햄락이 와 있고 첩보원을 써서 꼭 찾으라고 말한다. 크로스헤어는 몇달이 흘렀기 때문에 배드 배치 맴버들이 살아서 찾으러 올꺼라는 생각에 회의적이지만 오메가는 꼭 올거라고 말한다. 만나기로 한 장소에서 래커와 헌터는 반갑게 오메가를 맞이하지만 크로스헤어가 내리자 어색한 침묵이 흐른다.

빨간 인형을 안고 잠에서 깬 오메가. 셉과 리아나가 보낸 과일을 오메가에게 던져주는 래커. 오메가는 크로스헤어를 찾는데 헌터는 아직 적응 중이라고 말한다. 크로스헤어는 배처와 함께 해안에서 사격 연습을 하고 있는데 여전히 오른 손을 떨고 있다. 셉하고 리아나는 크로스헤어를 찾아왔었고 (과일) 오메가는 계속 숨어있을 수 만은 없고 헌터와 이야기 하라 한다. 헌터가 사격할 때 또 오른손이 떨리자 오메가는 에이지에게 그 손을 보여주라 말하자 자신은 멀쩡하다고 말하는 크로스헤어. 좋은 사격수가 되기 위한 조건을 말하다가 나를 지켜 보는 눈이 있다는 것도 알아야 한다고 하는 크로스헤어. 뒤에서 래커와 헌터가 지켜 보고 있다. 저 친구들은 나를 믿지 않는다고 말한다. 오메가는 이야기를 나눠야 한다고 말하고 헌터는 크로스헤어에게 총을 준 것이 좋은 생각인지 잘 모르겠다고 한다 래커는 오메가가 믿고 있으니 그걸로 된거라 한다. 에코의 비행선이 오고 사격을 보던 드로이드는 명중율이 53%라 한다. 크로스헤어는 자신은 안아주지 않는거냐 말하자 에코는 네가 가진 정보에 따라 다르다 말한다.
오메가는 자신이 시설에 있었던 경험을 이야기 한다. 클론의 샘플을 채취하면서 실험용으로 쓰고 있고 보관실에 무엇이 있는지는 자신도 모른다. 애머리도 거기엔 들어가지 못한다고 말한다. 크로스헤어에게 의견을 묻자 갇혀 있어서 잘 모른다고 답한다. 오메가는 날라 세의 데이터 패드를 건네며 지금은 접속이 안되는데 접속이 된다면 탄티스의 정보를 얻을 수 있을 거라 말한다. 에코는 테크가 없어서 암호를 푸는 일이 어려울 거라 한다. 크로스헤어는 제국의 단말기에 접속하면 암호를 우회할 수 있다고 말한다. 래커가 어디서 구하냐고 묻자 자신이 아는 시설이 있다 한다. 헌터는 크로스헤어. 에코. 자신이 그 시설로 간다고 한다. 오메가는 두고 간다고 했으나 거기에 있는 클론들이 남아 있다며 이 일을 꼭 해야 한다고 말한다.
여전히 눈치 주는 헌터. 크로스헤어는 오메가에게 헌터가 너를 걱정해서 그러는 거라 말한다. 그러자 오메가는 내가 더 나이가 많아 동생이라고 한다. 래커는 크로스헤어게게 옛날 군장을 가져다 준다. 버리질 못하겠다고 말하는 래커. 그 뒤로 헌터가 지켜보고 있다.
크로스헤어가 말한 기지에 도착한 배드 배치. 창고 내부에 열기도 없고 통신도 잡히지 않는다고 말하는 에코, 구 군장을 입고 내리는 크로스헤어. 전초 기지가 외딴 곳이라 했지 버려졌다는 말을 안 하지 않았냐고 묻는 헌터. 여기에 뭔가 더 있는 것 같다고 말한다. 센서를 보고 이상 행동을 보이는 배처. 헌터는 왜 센서가 있는지 의문을 품고 크로스헤어는 약탈자를 탐지하는 장치라고 말한다. 약탈자가 있다는 말은 안 하지 않았냐고 하자 크로스헤어는 자신이 모두 처리했기 때문이라며 도발한다. 오메가는 이야기를 나누랬지 누가 싸우랬냐며 크로스헤어에게 말한다. (그런데 이 사람 원래 예전부터 그랬음,)
배처가 눈을 치우고 래커가 문을 연다. 오메가는 센서 경보기가 기지 전력을 다 잡아 먹고 있다고 하자 에코가 전력을 모두 기지로 당긴다고 한다. 계속 의심스러운 눈초리로 크로스헤어를 바라보는 헌터. 클론 동료들의 헬멧을 위에 올리는 크로스헤어. 경보기의 전력을 차단하는 오메가. 날라 세의 데이터 패드가 정상 작동하자 에코는 탄티스에서는 클론 포로가 생각 보다 많다고 한다. 경계 확인하겠다며 밖으로 나가는 크로스헤어를 헌터는 따라 나간다. 헌터는 크로스헤어가 아직 말하지 않은게 있다고 한다. 무슨 짓을 했길래 제국의 눈 밖에 난거냐고 묻는다. 오른 손을 계속 떠는 크로스헤어. 뭔가 기지 내 냄새를 맞고 다니는 배처.
왜 마음이 변하거냐며 다그치는 헌터. 그들이 먼저 배신했기에 제국의 장교를 죽였다고 말하는 크로스헤어. 모든 게 다 내탓인 척 떠넘기지 말라며 난 경고하려고 했으며 그걸 무시한 건 헌터라며 말한다. 오메가가 그 고생을 한건 다 헌터 네 잘못이라고 하며 네가 아니라 내 도움으로 탈출해서 화가 난것 아니냐며 말하는 크로스헤어.그 말을 듣고 주먹을 움켜쥐는 헌터. 그 때 땅속에서 튀어 나오는 괴물. 센서 경보기는 약탈자는 물론 이 괴물을 감지하기 위해 있었던 것
건물 뒤에 예비 에너지 퓨즈를 작동시켜야 하는 상황. 괴물을 유인하는 책임을 맡는 크로스헤어와 헌터. 헌터는 깊은 동굴에 빠지게 되고 크로스헤어는 뒤를 따라 가겠다고 한다. 괴물이 크로스헤어를 쫓는데 오른 손 때문에 잘 맞지 않는다. 래커는 에너지 퓨즈가 있는 곳으로 가서 퓨즈를 작동시키고 항법기를 켠다. 전원이 들어오는데 헌터는 괴물이 경계를 지났는지 확인부터 해야 한다고 한다. 출구를 찾은 헌터와 크로스헤어는 괴물을 뒤쫓아 오는 걸을 피해 달리기 시작하고 다행히 경보기를 건낸 둘은 괴물을 피하게 된다. 서로를 보며 고개를 끄덕거리는 크로스헤어와 헌터. 결국엔 잘 해결되지 않았냐며 오메가에게 말하는 에코. 탄티스의 위치는 알 수 없지만 데이터 패드의 정보와 크로스헤어의 정보 덕에 클론 찾는게 더 나아졌다고 말한다. 그리고 오메가가 탄티스에서 탈출했던 것이 가장 중요했다고 한다.
기체가 이동 전 크로스헤어는 헌터에게 제국에서의 내 역할. 좋은 군인이라 생각했다고 말한다. 헌터는 그때 무슨 일이 일어나고 있었는지 이해한 사람을 아무도 없었다고 한다. 크로스헤어는 수 많은 짓을 저질렀고 실수도 많았다고 한다. 헌터도 나도 마찬가지 이며 더 나아지려고 노력하는 수 밖에 없다고 말한다. 우리에게 아직 희망이 있을지 라고 덧붙이며...

렉스는 랙서스 행성의 싱 의원을 데리고 추치 의원과의 약속 장소로 이동 중이나 이는 햄락이 만든 특수 요원들에게 이미 감시 받고 있었다.
싱 의원은 추치 의원이 만나자고 했을때 의아했다고 했다. 이미 클론 전쟁에서 적국이었기 때문에. 그러자 추치 의원은 같은 곳을 바라본다는 점에서 우리는 하나라고 말한다. 분리 주의 의회가 사라졌어도 독립에 대한 희망은 여전히 남아있다고 하는 두 사람. 싱 의원은 추치의 제안에 대해 묻는다.
지하로 침투한 특수 요원은 반란군인 그리어 요원을 제거하고 렉스는 특수 요원을 주방에서 발견한다. 도주 중이던 특수 요원은 정비탑 옥상에서 하워즈 요원에게 산채로 사로잡힌다. 하워즈는 요원에게서 고도로 암호화된 데이터 장치를 발견했다고 말한다.
햄락의 기지에선 특수 요원 트루퍼가 체포된 특수 요원이 살아있음을 알고 추적해 제거할 것을 명령한다. 렉스의 심문에도 별다른 소득은 없고 데이터 장치를 분석한 요원은 싱 의원 외에 오메가 또한 제거 대상으로 올라와 있다 말한다. 그러자 렉스는 헌터와 에코에게 알려주라고 말한다. 하워즈는 크로스헤어가 거기에 있고 탄티스 위치를 알려면 자기들이 심문해야 한다며 배드 배치 팀이 와야 한다고 주장한다.
반란군 기지에 도착한 배드 배치. 하워즈는 자신의 팀이 라일로스에서 크로스헤어에게 몰살되었음을 밝힌다. 에코는 오메가에게 레이저 소공을 가볍게 개조한 석궁을 선물한다.
특수 요원이 탄 비행선이 기지의 행성에 도착하고 렉스는 데이터 장치에 오메가도 있었음을 밝힌다. 하워즈는 명단에 크로스헤어가 없는 게 말이 안된다며 흥분한다. 제국이 왜 오메가를 쫓는지에 대해 묻자 오메가는 M 수치에 관한 실험을 날라 세에게 강요하려는 목적 때문이라고 말한다. 특수 요원은 기지 주변에 폭탄을 설치하고 오메가는 클론을 구할 방법을 찾아야 한다고 한다. 갑자기 크로스헤어는 더 알아야 할것이 있다고 말하면서 탄티스에 있는 클론이 모두 포로는 아니며 특수 요원으로 훈련된 클론 부대가 이들이 햄락이 운영하는 비밀 은폐 프로그램에 동원된다고 한다. 자신도 거기에 투입되려고 했으나 결함이 있어서 차출되지 못했다고 말한다. 여기에 그 포로가 있다면 그들이 이미 이곳의 위치를 알아냈을 것이며 햄락은 똑똑하기 때문에 추적당하지 않을 장비를 넣어놨을 거라 말한다. 특수 요원은 기지 내로 숨어 오메가를 과녁에 넣지만 쏘지 않는다. 기지에 보고하자 수색대를 증원하겠으면 그 아이는 반드시 생포해야 한다고 말한다.
포로를 보러 간 헌터와 크로스헤어. 크로스헤어는 당장 여기를 떠나야 한다고 말하고 특수 요원은 기지 중요 시설을 파괴하기 시작한다.
포로는 저격되고 특수 요원은 하워즈를 쏘고 땅에 떨어진 화염 방사기의 불이 땅에 떨어진 폭탄에 닿아 폭발하자 위에 있던 돌에 깔린다. 한편 수색대는 하이퍼 스페이스로 행성에 도착하고 커맨더 울프가 등장한다. 커맨더 울프는 오메가의 생포가 목적이라며 블라스터를 충격 모드로 설정하라고 한다.

돌더미에 깔려 죽은 줄 알았던 특수 클론 요원이 돌더미를 헤치고 일어나고 통신기 고장을 확인한다. 배드 배치와 렉스 분대는 지하 탈출구로 향하기 시작한다. 클론 요원은 수송기에서 내린 대장과 만나 아직 렉스 분대가 살아 오메가와 함께 갇혀 있다고 말한다. 울프는 렉스 분대가 첨탑 중앙을 통해 탈출하고 있음을 알게 되고 폭발물을 통해 입구를 막고자 하는데 특수 요원은 탈출로를 따라 들어간다. 사령 본대는 탈출구 입구 쪽을 봉쇄한다. 탈출 중이던 렉스 분대는 특수 요원과 만나고 특수 요원과 크로스헤어의 맞대결이 펼쳐지는데 크로스헤어는 오른손 떨림이 재발한다. 비행선을 타고 탈출하는 렉스 분대와 배드 배치. 하지만 특수 요원이 비행선을 맞춰 추락시킨다. 충격 모드로 바꾸지 않았다고 특수 요원을 질책하는 울프. 하지만 그는 표적의 탈출을 막은 것 뿐이라고 한다. 사령관은 표적(오메가)가 탄 비행선을 격추시키면 우리가 그 애를 무사히 데려오란 명령과 상충된다고 말한다.
추락한 렉스 분대는 에코가 철수 지점으로 말한 장소로 이동하자고 한다. 뒤를 따르던 수송대에서 내린 특수 요원은 렉스 분대를 뒤쫓는다. 하워즈(?)가 크로스헤어에게 이곳에서 오메가를 대하는 태도가 달라졌다 하자 한 때는 충성심이 전부였으나 제국에서는 소용 없었고 소모품에 불과하다는 걸 깨달았다 말한다. 수송대는 특수 요원이 이탈했음을 알아챈다. 렉스 분대의 이동로에 수송대가 먼저 도착해 부대원들이 내리자 연막탄을 던져 전투를 시작한다. 크로스헤어는 오메가에게 자기에게 꼭 붙어 있으라 말한다.
크로스헤어는 비행선의 조종사와 엔진 부분을 맞춰 비행선을 추락시킨다. 크로스헤어는 특수 요원과 1:1 매치를 시작하고 둘은 강물에 같이 빠진다. 얕은 물에서 둘은 싸우는데 특수 요원은 크로스헤어가 우리 편이 될 기회가 있었으나 편을 잘못 고른거라고 한다. 크로스헤어의 목을 눌러 수면 위로 못 나오게 하는데 뒤를 쫒던 하워즈가 특수 요원에게 총을 쏴 폭포 아래로 떨어 뜨린다.
에코와의 합류 지점에 먼저 온 것은 수송대. 이때 드디어 울프와 렉스가 만나게 된다. 울프는 오메가를 넘기면 공정한 재판을 받게 해주겠다고 한다. 렉스는 울프에게 명령을 따르라고 훈련 받은 건 아는데 당신이 지금 아이를 사냥하고 있다고, 형제로서 부탁한다며 옳은 일을 하라고 말한다. 결국 울프는 떠나는 렉스 분대를 잡지 않고 전사자들을 수습해서 떠난다.(반란군에서 울프와 렉스가 같이 있었던걸 보면 추후에 다시 등장해서 생체칩을 제거하고 합류할 듯 하다) 그들은 클론. 우리의 형제기 때문에...그리고 폭포에서 떨어진 특수 요원은 살아 있다.(남은 에피소드에서 할 일이 있을 지도)
헌터가 렉스의 부하들을 잃은 건 유감이라고 말하자 렉스는 전쟁이 끊나면 더이상 형제를 잃지 않은 줄 알았으나 자신의 생각이 틀렸다고 말한다. 헌터는 제국이 너무 강하기 때문에 이 싸움을 이길 수 없다고 한다. 하지만 렉스는 계속 싸울 것이며 제국이 오메가를 쫓고 있는 한 너희도 마찬가지라고 한다. 또한 탄티스에서 제국이 무슨 짓을 하는지 몰라도 그들에겐 오메가가 중요하고 오메가를 지켜내려면 그 자들에게 오메가가 왜 중요한지 알아봐야 할 것 같다고 말한다.

파부에 도착해 에코의 연락을 기다리며 발을 동동 구르는 오메가. 오메가는 제국이 자신을 쫓기 위해 벌인 일이었고 거기에 휩쓸린 나머지 에코와 동료 대원들이 희생되었다며 도울 방법을 고민하고 있다고 한다. 헌터는 햄락이 왜 너를 쫓고 있는지 M 수치의 실험이 왜 중요한지 알아야 하며 그때까지 오메가는 몸을 사려야 한다고 말한다. 래커가 피에게서 연락이 왔다고 하자 크로스헤어가 그가 누구인지 묻는다. 피는 M 수치에 대해 알아냈는데 일급 현상금 사냥꾼들이 M 수치 표적을 잡아서 제국에 넘기고 있다고 한다. 이에 헌터는 페넥 샌드에게 물어 보겠다고 한다. 피는 대가를 요구할 것이라 말하는 데 크로스헤어의 오른손이 또 떨고 있다. 헌터는 페넥 샌드는 위험한 존재라며 크로스헤어와 같이 파부에 있으라 말하며 크로스헤어가 저 손을 검사하도록 잘 설득해보라 한다.
헌터가 페넥 샌드에게 정보를 얻으려 하자 비용을 요구한다. 자신은 M 수치 표적을 찾는데에 관심이 없지만 알고 있는 자를 연결시켜준다고 한다. 다만 비용이 많이 들뿐. 피가 원하는 현상범을 잡으면 거래를 놓아주겠다고 한다. 다만 현상금은 전액 페넥이 갖는 조건으로... 파부 행성에서 검사를 받는 크로스헤어는 문제의 원인이 육제적인 것이 아닐 수 있다는 말을 듣는다. 그리고 화를 내며 자리를 벗어 난다.
이동 중인 비행선에서 래커가 패넥 샌드를 못 믿겠다고 하자 그녀가 들어와 너희가 조건을 이루면 나도 대가를 치른다고 말한다. 쫓는 자는 오도 에리스의 살인자 사일러 새러스. 저 자를 잡으려 했던 사냥꾼들은 모두 살아 돌아오지 못했다고 한다. 그녀는 배드 배치에게 물살을 잘 보라하며 사일러는 상류 어딘가에 숨어 있을 거라 한다. 래커에게 엄호를 맞기는 샌드. 그리고 물속을 잘 지켜보라며 자신을 절대 들어가지 않겠다고 말한다.
기뢰를 발견하자 시동을 끄라는 헌터. 수없이 많은 기뢰가 매설되어 있는 것으로 보아 지역 전체가 부비 트랩이라 말한다. 그러자 잘 찾아온 것이라 말하는 샌드. 헌터는 돌아가는 것이 상책이라 하지만 샌드는 돌아가는 것은 사일러의 뜻이라며 우리는 이 길로 들어가 통수를 치겠다고 말한다
파부 섬에선 크로스헤어와 오메가가 사격 연습을 한다. 오메가는 손을 고칠 수 있는 건 크로스헤어 자신 뿐이라고 말하며 자신이 하는 방식을 따라 오라고 한다.
악어형 괴물들이 다가 오고 있어 빨리 기뢰를 해체해야 한다고 말하는 샌드. 배드 배치들은 괴물들을 물리치고 또 다른 영역에 들어선다. 페넥 샌드는 자신의 과거에도 불구하고 정보를 찾으러 온 건 너희에게도 굉장히 중요한 정보일 거라 말한다. 샌드는 오메가를 놓친게 아니라 풀어준 것이며 의뢰인(날라 세)이 배드 배치와 함께 있는게 더 안전하다고 느껴 의뢰를 취소했기 때문이라고 한다. 샌드는 사일러를 반드시 생포해야 한다고 말한다. 헌터와 맞붙어 싸우던 사일러는 땅으로 내려가 이들이 타고 온 보트에 오르지만 샌드가 이미 선을 잘라 놓았고 결국 샌드의 기절총에 맞고 잡힌다. 파부에선 오메가가 카쉬크의 우키들에게서 배운 명상을 통해 크로스헤어 치료에 나선다.
패넥 샌드는 사일러를 넘기고 난 이후 정보를 가져다 준다고 말하며 행성을 떠난다. 비행선에서 패넥은 누군가와 통화하는데 너라면 쉽게 찾아낼 수 있을 거라 말하며 정보를 보낸다.

파부섬에서의 평화로운 일상. 헌터는 아직 페넥으로부터 연락이 없다 말하며 M 수치가 뭔지 알면 제국이 오메가를 쫓는 이유를 알 수 있을 거라 말한다.배처와 던지기 놀이를 하던 오메가는 배처가 동굴 앞에서 무언가 있다는 내색을 하자 전에도 와본 곳이라면서 다시 탐색하가사 한 인물과 마주치게 되는데 그 인물은 아사즈 벤트리스
벤트리스가 오메가를 밖으로 끌고 나오다가 배처의 안내를 받고 따라온 배드 배치와 마주친다. 벤트리스는 이미 오메가와 배드 배치의 정체를 알고 있다. 그녀는 벤트리스 수치에 대해 궁금해 한다는 것을 안다며 왜 이 정보를 원하는 지 말해 보라고 한다. 오메가는 어떤 사람이 제국에게 쫓기고 있는데 제국이 실험하는 M 수치 때문이라고 생각한다. 하지만 우리는 그것이 무엇인지 모른다고 말한다. 벤트리스는 그것은 핏속에 포함되어 있고 인간은 누구나 가지고 있지만 수치가 다르다고 한다. 수치가 높으면 포스를 쓸 수 있는 능력이 강하다고 믿고 있다고 한다. 피만 가지고는 제다이가 되지 못 하며 수련을 해야 한다고 한다. M 수치가 높다면 제국이 사냥하러 올지 모르니 조심하라고 말한다. 떠나려는 벤트리스를 오메가가 붙잡으며 제국이 그런 이유로 자신을 쫓는 거냐며 묻는다. 벤트리스는 미디클로리언 수치를 알여면 시험을 해봐야 한다고 말하자 오메가는 자신이 시험을 받겠다고 말한다.
크로스헤어는 테크의 공화국 기록 보관소 파일을 보고 그녀가 아사즈 벤트리스라는 것을 알아내고 그녀가 분리주의 암살자 중 하나라는 것을 말한다. 오메가를 테스트 중이던 벤트리스는 오메가를 멀리 쫓아내고 배드배치와 싸우는데 배드배치는 무기력 하게 무너지는 듯 하다가 총을 잡고 다시 일어선다. 하지만 벤트리스는 너희들을 죽일 생각은 없었다면서 노란색 라이트 세이버를 꺼내든다. 꽃을 따온 오메가가 싸움을 말리는데 배드배치는 다 실신되었고 헌터는 옐로우 세이버에 목이 걸려 있으면서 이 여자가 전쟁 범죄자라며 오메가에게 이른다. 벤트리스는 시대가 변했으며 클론도 받아들이라고 하지만 헌터는 자신들은 다르다 한다. 벤트리스는 마찬가지로 우리들은 전쟁의 소모품에 불과했고 제국은 너희가 생각하는 것 보다 훨씬 위험하다고 말한다. 그리고 내 신분은 다양하지만 너희들의 적은 아니라고 한다.
헌터는 머로더에서 오메가에게 벤트리스가 무슨 짓을 했는지 너는 모르지만 우리는 안다며 벤트리스의 위험함을 주장한다. 오메가는 벤트리스가 나쁘다고 치자. 그런데 왜 너희들을 살려 뒀을까라고 묻는다. 사람을 바뀔 수 있으며 자신도 크로스헤어를 포기하지 않았듯 기회를 달라고 한다.
오메가와 항구에서 만난 벤트리스. 벤트리스가 가지 않고 여기에 머무르고 있는 건 자신을 도와주기 위한 거 아니겠냐고 되묻는 오메가. 바다에 나가 마지막 시험을 치르기로 한다, 멀리 나온 이유는 집중하기가 쉽고 포스를 쓰는 사람들은 자연을 좋아해서 자신들의 에너지에 반응하는 많은 것들과 연동한다고 말한다. 시험을 포기하는 오메가, 벤트리스는 배드 배치가 과잉 보호했기 때문에 훈련이 부족했다 말한다. 벤트리스는 네가 포스 잠재력이 있어도 저들이 활용법을 알려주지는 못한다고 한다. 이에 오메가가 왜 당신의 말을 들어야 하냐고 묻자 벤트리스는 앞으로 나가 포스를 전개한다. 배 주위로 물고기가 몰려드는 광경에 놀라는 오메가. 상황이 이상해짐을 감지한 배드배치는 현장으로 머로더를 타고 가고 오메가는 거대 촉수 괴물에 붙잡힌다. 오메가를 구하는 벤트리스. 벤트리스는 괴물을 공격하는 배드배치에게 상황을 곤란하게 만들고 있다며 자신이 처리하겠다고 한다. 촉수에 잡혀 괴물에게 끌려 간 벤트리스는 서로 교감하여 괴물을 돌려보낸다.
벤트리스는 오메가의 M 수치가 높지 않다고 말하자 오메가는 왜 제국이 자신을 쫓는거냐고 묻는다. 오메가가 자리를 뜨자 크로스헤어가 거짓말이라 하고 벤트리스는 오메가가 잠재력이 있다면 수련을 해야 하고 그러자면 너희들을 떠나야 한다고 말한다. 헌터는 그럴 일은 없다고 하자 벤트리스는 문제는 제국이 오메가 찾는 것을 멈추지 않을거라고 한다. 나라면 파부섬을 떠날 것이라고. 너희는 생각만큼 안전하지 않다고. 거래는 여기까지 라고 하며... 크로스헤어가 여전히 어느 편인지 모르겠다고 하자 벤트리스는 난 내편이라고 한다. 그리고 난 목숨이 몇개 남아 있기 때문에 제국이 쫓는 건 신경 쓰이지 않는다고 말한다.

두귀 외계인이 물병을 던졌다는 의심을 받고 사람들은 그 아이가 저주받은 재능을 부여받았다고 말하며 자리를 뜬다. 자리에 있던 다른 외계인은 현상금 사냥꾼에게 고급 정보라며 그 아이의 위치 정보를 넘긴다.
에머리 카는 햄락에게 날라 세가 감금된 이후 실험에 진전이 없다고 말한다. 카미노족을 믿을 수 없다고 햄락이 말하자 자신은 믿을 수 있냐며 보안 등급을 올려달라고 한다. 그러자 햄락은 네크로맨서 프로젝트에 대해 알려 주겠다고 한다. 앞으로 지하 격리실의 자산 뿐만 아니라 보관실에 대한 접근 권한도 생긴다고 말하는 햄락. 보관실에는 M 수치가 높은 아이 3명이 있었고 M 수치가 높은 성인은 남아 있지 않다고 한다. M 수치는 수급자에게서 바로 복제가 안되지만 날라 세는 그 방법을 알고 있고 그러기에 오메가를 탈출시켰다고 한다. 오메가의 혈액은 M 수치의 수준을 재생해 주는 DNA와 호환되는 유일한 접합체라며. 그래서 오메가를 찾아야 한다고 한다.그리고 표본과의 개인적인 접촉은 하지 말라고 한다. 저들은 과학적 자산일 뿐이라고며. 한 아이(SP-32)가 햄락이 나갈 때 패스워드? 같은 걸 유심히 본다.
두귀 외계인 집에 낯선 발걸음이 감지되자 엄마 외계인은 경계를 하는데 찾아온 자는 케드 베인. 피를 검사하더니 이 정도면 됐다고 데려간다.
다시 기지에선 3명 중 한 아이인 에바가 피검사를 받는다. 아이가 그 동안 집에 언제 갈 수 있는 지 날라 세 박사에게 물어봤다고 하자 날라 세가 없어졌으니 이제 자신이 알아본다고 한다. SP-32(잭스)를 검사하려는 도중 SP-32는 에머리의 업무 패드를 빼앗아 탈출을 시작하지만 감금 장치가 작동되고 클론들은 기절 모드로 SP-32를 잡아 방에 가둔다.
날라 세를 찾아간 에머리는 네크로맨서 프로젝트 역할에 대해 묻는다. 날라 세는 내 자리를 대신 한거냐, 그럼 표본을 봤냐고 묻는다. 날레 세는 제국은 그 아이들을 살려두고 통제할 것이며 오메가를 지켜야 했다고 말한다. 다른 아이들은 어떻게 하냐고 묻자 날라 세는 할 수 있는 건 다했고 이제 에머리 당신을 바라보게 될 것이라고 한다. 에머리가 자신이 할 수 있는 건 없다고 하자 과연 그럴까 묻는 날라 세. 에머리는 방을 떠난다. 햄락은 오늘 새로운 표본이 도착할 것이며 이번 아이는 위험하지 않을 것이라 하자 에머리는 자신도 동행하고 싶다고 한다. 그럼 뜻대로 하라는 햄락. 타킨 총독의 호출에 햄락은 팰퍼틴 황제가 지시한 극비 업무라 말하지만 총독은 적절한 결과를 내지 못하면 박사 개인의 신상에도 좋지 않을 것이라 한다. 클론 비밀 요원을 호출한 햄락은 꼭 오메가를 잡아 오라고 말한다.
케드 베인을 만난 카르. 두귀 외계인이 너무 어리다고 말하며 표본을 검사하겠다고 한다. 시설로 돌아온 에머리는 에바로 부터 거짓말쟁이라는 비난을 받는다. 오메가가 남기고 떠난 인형을 꺼내 보는 에머리. 그리고 그 인형을 에바의 방 앞에 놓는다.

피 지노아의 항해선이 행성에 도착하고 연료를 채우는 동안 클론 비밀 요원이 배의 탑승해 함선의 데이터를 빼 달아난다. 그리고 파부 행성에 대한 자료를 얻어내 조사를 계획한다.
파부를 떠날 준비를 하는 배드배치. 리아나와 함께 의미 있는 물품을 두는 곳에 간 오메가는 그 곳에 인형과 테크의 안경을 남겨둔다. 행성에 도착한 클론 비밀 요원은 시내로 잠입하고 이상한 느낌을 알아챈 헌터는 오메가를 불러들인다. 비밀 요원이 오메가를 발견하고 오메가를 제외한 클론은 제거하란 명령을 받는다. 래커가 머로더에 짐을 싣다가 비밀 요원이 부착시킨 폭탄의 존재를 알아채려 피하다가 바다에 떨어지고 머로더는 파괴된다. 래커는 치료 로봇에 보내고 크로스헤어는 우리 위치가 발각되었다고 말한다. 곧 제국의 함선들이 섬에 도착하고 클론 병사들이 내린다. 클론 비밀 요원은 도로를 전부 차단하고 배를 모두 부술 것을 명령한다. 헌터와 크로스헤어는 제국의 함선을 탈취하기로 하고 헌터가 행동에 나선다. 비밀 요원은 시장에게 오메가를 넘기지 않으면 파부섬은 잿더미가 될 것이라 경고한다. 리아나가 숨어있는 집으로 이동한 크로스헤어와 오메가. 헌터가 건쉽을 탈취하려 하자 클론 비밀 요원은 운전하는 클론을 총으로 쏴 죽안다. 오메가는 자기가 잡혀 끌려 가는 것이 최선이라 말한다. 오메가는 클론 비밀 요원의 비행선에 오르고 크로스헤어는 추적 장치를 붙이려 했으나 실패한다. 함선은 햄락의 시설로 향한다.

햄락의 기지 탄티스로 끌려온 오메가. 햄락은 자신 앞에서 오메가를 검사하라고 에머리 카 박사에게 지시한다. 오메가가 날라 세를 묻자 햄락은 그 카미노족이 널 빼돌일 일은 이제 없을 거라고 말한다. 오메가는 에머리에게 꼭 이래야 하냐고 묻자 그래야 한다고 하고 네가 무사해서 다행이라고 말한다.
파부섬에서 헌터는 제국이 전파 방해는 풀지 않았다고 말한다. 래커가 오메가가 제국에 끌려간 것에 대한 불만을 표시하자 크로스헤어는 파부섬의 주민들을 살리기 위해서 였다고 말한다. 헌터는 비행선이 있어도 탄티스를 찾을 수 없다고 하자 크로스헤어는 램파트 제독이 위치를 알고 있다고 한다. 이제야 말하는 이유는 다시는 탄티스에 가고 싶지 않았으며 램파트는 신뢰할 수 없는 자이기 때문이라고 한다.(오른손을 계속 만지며) 하지만 지금 달리 방도가 없기 때문이라고 말한다. 그러자 갑자기 지하에서 피 지노아가 올라온다. 배드배치는 피의 함선을 빌려 에레버스의 강제 노동 수용소로 가기로 한다.
피가 지인에게 부탁해서 얻은 강제 노동 수용소 지도를 공개하자 헌터는 들키지 않고 경계선까지 갈 수 있는지 묻는다. 당연한거라 말하는 피. 그러나 경계선을 넘어가면 초병, 센서, 정찰병이 있다고 한다. 피에게 표적을 잡으면 연락할테니 데리러 오라고 한다.
피의 스텔스 낙하로 행성에 침투한 배드 배치. 초소에서 램파트의 위치를 추적한다. 교대 신호가 울리지 않자 이상하게 생각하는 램파트 제독. 광산에서 나와 교도소로 이동하는 제독을 발견하는 배드 배치. 제독을 납치하기 쉬운 최선의 방법은 가는 도중 낚아 채는 것이라 말하는 헌터. 터보 탱크를 칠 것에 흥분하는 래커. 터보 탱크에 올라탄 배드 배치. 55번 작전으로 죄수들이 감금된 곳의 클론들을 제거하는 크로스헤어와 래커. 램파트 제독은 크로스헤어의 죄수 번호인 CT-9904를 기억해 부른다. 제독은 자기가 원하는 것도 들어줘야 한다고 하며 일단 이 행성을 벗어난 후 이야기하자고 한다. 다리에서 다른 터보 탱크를 만나 교전하지만 바퀴를 쏜 다음 점프(?)해서 현장을 벗어난다.바퀴가 맞아 조종이 불가능해졌을 무렵 피의 전함이 다 가와 배드 배치를 구조한다.
탄티스에서 햄락이 오메가의 검사 결과를 묻자 에머리는 M 수치에 유의미한 결과가 나왔다고 말한다. 햄락은 한 개인의 M 수치는 직접 복제할 수 없었지만 오메가 샘플과 다른 표본을 섞었더니 되었다고 한다. 그리고 오메가를 3명의 실험체가 있던 공간에 데려간다.

탄티스 섬의 실험체 수용 시설에서 오메가는 시설의 환경을 파악하기 시작한다. 에바와 이야기를 나누던 오메가는 자신의 인형이 에바에 손에 들려 있음을 본다. 에바는 잭스. 새미, 베이른을 소개한다. 잭스는 여기있는 실험체들이 이야기하는 걸 관계자들이 싫어하며 오메가가 사고를 칠 경우 상화이 더 안 좋아질 거라고 말한다.
램파트 제독은 피가 내려준 곳에 불만을 표시하며 자기는 탄티스 기지에 대해 다 말했는데 왜 풀어주지 않냐고 헌터에게 투덜거린다. 헌터는 기지의 정확한 좌표를 알려줘야 풀어주겠다고 말한다. 에코가 이동을 위한 함선을 가지고 도착하고 저 제독을 믿을 수 있겠냐고 한다. 제독은 햄락이 기지의 위치를 감추기 위해 삼중의 안전 장치를 해두었고 거기에 들어가려면 코러산트 궤도의 003 기지에 먼저 정박해야 하고 거기에서 좌표를 직접 전송 받는다고 말한다. 에코는 그 궤도에 정거장이 있지만 나머지 얘기는 확인할 수 없다 한다. 헌터는 기지에 도착하면 탄티스로 가능 비행선을 찾아 좌표를 빼내자고 한다. 크로스헤어가 제국군 승인 코드가 있어야 하고 에코가 확보했다고 하자 램파트는 주기적으로 바뀐다고 말한다. 그러면 빨리 가자는 헌터. 그리고 램파트를 제국군으로 꾸미고 자신들이 경호원으로 위장하면 된다고 한다. 자신은 중장이었는데 대령 제복이라 안된다고 하자 강등 드랍을 치는 에코.
에머리가 피를 뽑으러 들어오자 다른 아이들은 어디서 왔냐고 묻는 오메가. 자신은 모르며 잘 지내고 있다고만 말한다. 그 사이 에머리가 들고 왔던 접시에서 핀을 훔친 오메가. 다른 직원이 오메가와 다른 실험체와 어울리게 두는 건 좋지 않다 말하지만 에머리는 정신을 활성화하는 프로그램을 아이들이 따를 뿐이며 우리가 지켜 보고 있지 않느냐며 넘어간다. 하지만 그런다고 오메가가 사고를 치지 않는 건 아니잖냐라고 응대하는 과학자. 그러자 수석 과학자는 자신이라면서 운영은 자신이 한다고 한다. 드로이드의 생체 정보 수집 시간을 에바에게 묻는 오메가. 트루퍼는 우리들이 사고 쳤을 때만 온다고 잡하는 잭스. 오메가는 여기서 탈출한 경험이 있고 자신은 훈련되어 있다고 말한다. 그리고 여기서 너희들을 데리고 탈출하겠다고 한다. 드로이드만 해치에 접근할 수 있다 말하자미나 핀을 보여주며 자신이 들어가 보겠다고 하며 그 동안 너희들이 주목을 끌어달라고 말하는 오메가.
복장의 전투 무늬를 지우는 에코. 램파트는 자신이 얼굴로만 중장이 된건 아니라며 개드립을 친다. 램파트는 배드배치와 임무에 대해 불신하지만 크로스헤어는 자신들이 너를 믿는 것처럼 너도 우리를 믿어야 한다고 한다고 말한다. 도착 후 비행선을 맞는 중위가 복장을 따져 묻자 가볍게 내 병사들이니 타킨 총독에게 연락하라며 중위를 날려 버리는 램파트. 관제실 앞에서도 복무 규정을 운운하며 경비 트루퍼들을 날려 버리는 램파트. 관제실로 들어가 드로이드에게 적하 목록을 보여 달라고 말한다. 접근 카드를 보여 달라고 하자 총을 제압하는 헌터, 앞서 나타났던 중위가 이 함선의 출발 기지가 맞지 않는 다며 래커에게 식별 부호키를 달라고 한다. 함선의 문을 닫고 가볍게 제압하는 래커. 관제실에서는 에코가 탄티스로 출발한 과학선의 위치를 알아낸다. 좌표를 빼내라 하지만 발진 후에 과학선으로 직접 전송된다고 말하는 에코. 그러자 과학산에 직접 올라타자고 말하는 에코. 승선한 후 근접 센서를 무력화 할 방법을 찾아보라고 한다.
탄티스에서는 오메가가 계획을 실행시켜 방의 해치에 접근하는 법을 알아냈으나 블럭이 무너지고 때마침 에머리와 다투었던 과학자(스칼더)가 이상을 느껴 밑으로 내려 온다. 하지만 이미 방을 치워놓은 오메가. 그리고 아이들에게 나가는 길을 찾았다고 말한다.
과학선의 이륙 준비가 진행되는 상황에서 아스트로맥 드로이드가 올라가는 흡입 창구로 에코는 잠입에 성공한다. 근접센서를 꺼버리는 작업을 하는 에코. 하지만 이상 신호가 발견되어 트루퍼들이 내려가지만 에코에 의해 제압되고 실패했다며 램파트가 화를 내지만 헌터는 과학선이 하이퍼스페이스 점프를 하려는 순간 과학선에 밀착하여 작전을 성공시킨다.

탄티스에 도착하기 전 본체에서 떨어져 도보로 침투할 계획을 세우는 헌터. 밀림을 위험하고 에코의 탈출 계획은 미지수지만 어쨌든 작전을 실행한다, 탄티스에서는 클론 포스 99가 우주 정거장에 침투했다는 사실을 보고 받았고 따라왔을 가능성이 있기에 햄락은 전투기를 통해 영공을 살펴 보라고 지시한다.
탄티스에 도착 후 기체에서 분리하지만 이미 감시하고 있던 전투기에 의해 발각되고 실험실에선 기지가 흔들리는 충격이 있자 오메가는 그들이 자신을 찾은 거라 말한다. 배드 배치가 타고 온 함선은 격추되고 램파드와 팀원들은 밀림에 뛰어내린다. 과학선이 도착하자 선내를 수색하고 승무원들을 전부 스캔할 것을 지시하는 햄락. 에코는 자신이 기절시켰던 클론 트루퍼의 옷을 입는다. 크로스헤어와 래커가 한조가 되어 기지쪽을 향하는데 크로스헤어는 아직도 오른손에 문제가 있음을 보여 주고 (실제 이런 신들이 앞으로의 에피소드에서 문제로 나타날지는 모른다.) 곧 헌터와 램파트와 만난다. 수색대가 추락한 기체를 발견하고 사람이 없음을 확인한다. 과학선에서 조사 중인 에코는 드로이드에게 발각되었지만 쉽게 제거하고 손을 얻고 신분 확인 하려는 줄에서 벗어나 기지로 잠입한다.
실험실에서 오메가는 미리 작업해둔 방의 탈출구를 통해 내부로 들어가고 에코는 기지로 들어와 실험실의 위치를 찾는다. 램파트가 쉬려고 기댄 곳이 외계 생물이었고 블라스터로 쏠 수 없기 때문에 도망친다. 생물의 소리를 알아채고 배드배치를 발견했지만 뒤따라 오던 생물의 재물이 되고 만다. 하지만 램파트는 수색대에게 사로 잡힌다.
실험실의 채혈이 시작되고 아이들이 시간 지연을 통해 시간을 번 오메가는 무사히 방으로 들어온다. 연구실에서 오메가의 정보를 알아내려던 에코는 에머리에게 발각되고 에코가 오메가를 데려갈 거라고 하자 자신은 자신의 일을 했을 뿐이라고 말한다. 당신도 클론인데 왜 이런 일을 하고 있냐고 묻고 오메가가 당신은 다르다던데 그 말을 믿고 싶다고 하며 오메가의 치를 묻는다. 에머리는 아이들은 보관실에 있는데 자신의 도움도 필요하다고 말한다. 그리고 오메가 뿐만 아니라 다른 실험체들도 있다고 한다. 실험실에서 오메가는 굉장한 걸 발견했다며 너희들의 도움이 필요하다고 말한다.

기지까지 5km 남은 상황. 햄락은 봉쇄가 풀리기 전까지 보관실을 지키라 클론 부대에 지시한다. 수색대에게 잡힌 램파트를 만나는 햄락. 햄락은 클론 포스 99가 오메가를 구하러 올 줄 알았고 오메가와 관련된 중요한 임무를 수행 중이라고 말한다. 그리고 그 장면을 옆에 있던 날라 세가 듣는다.
에머리는 에코에게 봉쇄가 지속되면 결국 발각될 것이라며 어서 빠져 나가라 말한다. 에코는 오메가가 갇혀 있는 보관실의 정보가 없음을 묻는다. 데이터 뱅크는 철저하게 암호화되어 있고 경비가 삼엄하지만 자신이 들여보내줄 수 있다고 말한다. 왜 돕냐고 묻자. 자신이 기지에 대해 잘못 생각했고 옳은 일을 하려고 말하는 에머리
보관실에서 오메가는 여길 나가서 배드 배치를 만난다면 빠져나갈 수 있다고 다른 아이들에게 말한다. 아이들은 감시 드로이드를 고장내고 오메가는 이를 개조하려고 시도 한다. 아이들이 없자 다른 과학자가 보관실로 내려 오는데 이미 개조된 드로이드는 과학자를 마취총으로 잠재우고 오메가가 뚫어 놓은 벽을 통해서 오메가를 포함한 아이들은 빠져나간다.
보관실로 내려 가는 에코와 에머리. 아이들이 어디서 왔냐고 묻자 제국이 의료 실험에 아이들의 유전 물질이 핗요했기 때문에 현상금 사냥꾼들을 고용해 잡아들였으며 그 사실을 최근에 알았기 때문에 아이들을 도우려 한다고 말한다. 오메가는 황제가 목적을 이루려면 꼭 필요하며 그 프로젝트의 명칭은 네크로맨서라고 한다.
이동 중 지난 번 갔던 장소에 도착했고 아이들은 클론들에 의해 발견되었지만 오메가는 질로(해저 괴물_의 봉쇄 장치를 풀어 혼란을 초래시킨다. 보관실에 도착한 에코. 에머리는 이미 아이들이 탈출한 상황임을 알게 되고 햄락은 다른 여성 과학자인 스칼더 탓이라고 한다. 질로의 탈출 사실이 전해지자 헴락은 원자로 작동 중지를 명령하고 에머리에게 아이들을 찾으라고 명령한다. 오매가의 운명에 그녀의 운명도 걸려 있다고 말하며...
배드 배치 팀은 밖에서 기지에 들어갈 기회를 엿보고 있는데 크로스헤어의 오른 팔이 심하게 떨린다. 래커가 부상 때문에 힘들어하자 크로스헤어는 너희들은 통신실로 가서 랙스 대장에게 연락하고 기지엔 자신이 혼자 침투하겠다고 한다. 클론 포스 99는 테크의 죽음으로 끝났고 우린 더 이상 그 팀이 아니라고 말한다. 자신이 기지에 있어서 자신이 가장 잘 안다면서 모두 들어가면 모두 죽을 뿐 자신이 혼자 가는 것이 나은 판단이며 오메가는 너희 들이 필요하다고 한다. 난 대가를 치뤄야 한다면서. 하지만 헌터는 오메가에겐 우리 모두가 저 안의 클론들도 우리가 필요하다고 말한다. 우린 함께 한다고... 질로가 기지 밖으로 빠져 나오며 왼발로 클론을 짓 밟아 죽인다.크로스헤어가 누구 작품이냐고 묻자. 둘은 오메가 작품이라고 말한다.
오메가가 질로가 빠져 나간 곳으로 나가자고 하자 남자 아이는 높은 곳이 무섭다고 한다. 오메가는 자신의 동료인 래커고 높은 곳을 무서워 하지만 자신이 아는 한 가장 힘센 군인이라고 말한다.
햄락에게 질로가 기지 외부로 탈출했다고 보고하자 햄락은 셔틀을 보내 쫓으라 한다. 하지만 그러면 배드 배치가 약해진 방어선을 뚫고 온다고 말하는 클론. 하지만 햄락은 시키는대로 하라고 명령한다. 햄락은 기지 내부의 비밀 장소로 이동하는데 그곳에서 개조된 클론 4명을 풀어준다. 에코, 에머리는 질로가 있던 장소에 가는데 그 곳에서 탈출구인 수송 격납고로 갈 수 있는 가장 가까운 길을 묻는다. 배드 배치팀과 새로운 클론 4명. 클론 부대와 만나고 상대가 어려울 것을 안 배드배치팀은 후퇴하기로 했지만 클론 4명에 의해 쉽게 제압된다. 에머리와 함께 이동 중인 에코는 끌려 온 배드 배치팀을 보게 되지만 아이들을 먼저 찾는게 우선이라고 한다. 에코가 다른 클론들에게 잡힐 뻔한 아이들을 구조한다. 셔틀 앞에서 에머리에게 정해진 좌표로 가라고 부탁하고 오메가와 에코는 기지에 남는다.
햄락은 새로운 클론이 있던 기계에 배드 배치팀을 집어 넣고 정신 개조를 실시하는데 이번엔 크로스헤어가 실험되었던 방법과 달라졌다고 말한다. 클론이 잡혀 있던 수용 시설에 도착한 에코팀은 클론들을 풀어주는데 날라 세 박사와 램파트도 풀려 난다. 잡혀있던 클론은 배드 배치팀이 훈련실에 수용되어 있는 것 같다고 말하자 오메가는 어디인지 알 것 같다고 말한다. 램파트는 최대한 빨리 여기를 뜨는 것이 현명하다고 하자만 클론은 형제를 두고 가지 않는다고 에코가 말하자 다른 클론들도 동의하며 함께 싸우자고 한다, 날라 세는 제국의 손에 자신의 과학 기술을 넘겨 줄순 없고 오메가가 자유로워 질 수 있는 길은 햄락이 사라지고 데이터 뱅크를 파괴하는 것 뿐이라고 말한다. 그러자 오메가는 실험실로 가자고 하자 날라 세는 너는 동료들과 함께 있어야 한다고 말하자. 오메가는 날라 세에게 데이터 패드를 넘기고 배드 배치팀을 찾기로 한다. 램파트는 날라 세를 쫓아간다. 타킨 총독은 곧 탄티스에 도착하니 직접 상황을 보면 될 일이라고 말한다. 실험실에 도착한 날라 세는 데이터를 지우려고 하지만 뒤따라간 램파트가 총을 겨누며 이를 말리며 네크로맨서 프로젝트가 무엇인지 날라 세에게 묻는다. 하지만 날라 세는 뒤로 폭탄을 작동 시킨다.
훈련실에 도착한 에코팀은 클론 4명에게 밀리는데 오메가는 상황을 보면서 배드 배치팀의 자물쇠를 푼다. 하지만 다를 클론 4 중 1인 에게 발각되고 때마침 들어온 햄락은 클론들의 약점은 서로에 대한 애착이 큰게 문제라고 말한다. 램파트는 자신이 카미노의 기술을 황제와의 협상 카드로 쓰겠다고 말하며 날라 세를 죽이지만 손에 들고 있던 폭탄이 작동해 실험실을 폭파된다.
햄락을 가스를 유포하고 에코도 클론 4인에게 사로 잡힌다. 클론이 들어와 날라 세의 데이터가 담긴 실험실이 폭파되었다고 하자 햄락은 오메가가 있으니 상관없다고 말한다. 한가지 잊은 게 있다고 말하는 오메가. 자신들에겐 형제가 있다고... 래커가 깨어나고 혼란한 상황이 되자 햄락은 오메가를 잡아 빠져나가고 깨어난 헌터와 크로스헤어는 클론 4를 정리한다.
탈출할 비행선이 있는 곳에 오메가와 함께 나간 햄락. 하지만 크로스헤어와 헌터가 함선을 쏴 추락시킨다. 오메가는 햄락이 채운 수갑을 풀려하고 헌터는 오른손이 불편한 크로스헤어에게 수갑을 쏘라 하지만 크로스헤어는 못한다고 한다. 하지만 헌터는 오메가가 어떻게 할지 알고 있다며 오메가의 행동을 기다렸다가 쏘라고 한다, 오메가가 신호를 주고 크로스헤어는 수갑을 맞추고 헌터는 햄락을 쏴 깊숙한 곳으로 떨어 뜨린다. 오메가는 잠시 고민하더니 크로스헤어와 포옹하고 클론들과 배드배치팀은 탄티스를 떠난다.
탄티스 행성에 도착한 타킨 제독. 햄락의 사망, 데이터 뱅크의 파괴 등을 보고 받자. 시설은 무기한 폐쇄하고 모든 자금은 스타더스트 프로젝트로 돌린다고 말한다.
파부 행성에 모두 모인 클론과 스타더스트, 실험체 아이들. 에코와 에머리는 판토라에서 클론들의 정착을 돕기 위해 떠난다. 헌터는 아이들의 가족을 찾아주기 위해 랙스 대장과 논의 중이며 그때까지 우리가 돌 본다고 이야기 한다. 셔틀에 오르는 에코와 헌터는 눈 인사로 헤어진다. 오메가는 다른 클론은 어떻게 할지 헌터에게 묻는다. 클론들은 알아서 결정할 거라고 말한다. 평생 싸움은 지겹게 했으니 어떤 사람이 될지 선택해야 하고 각자 자신의 길을 자유롭게 결정할 것이며. "원하는 건 뭐든 될 수 있다며."
성장한 오메가. 반란군에 파일럿이 부족하다며 헌터에게 떠난다고 말한다. 헌터는 우린 너를 지킬 생각뿐이라고 하지만 오메가는 지금까지 자기를 지켜줬고 자신도 이제 아이가 아니라고 말한다. 그러나 헌터는 여전히 너는 우리 아이라고 한다. 언제까지나... 오메가는 이 싸움은 자신의 싸움이라고 하며 준비됐다고 한다. 하지만 헌터는 준비가 돼지 않았다고 한다. 오메가는 자신이 없는 동안 크로스헤어와 래커, 배처를 잘 돌봐 달라고 한다. 헌터는 자신들이 필요하면 언제든지 달려갈 거라 한다.비행선 조종석 앞에는 테크의 깨진 안경이 놓여져 있다.